提取序列 blast -evalue 參數(shù)設(shè)置了期望閾值（ E-value ）為 1e-5， E-value 是衡量比對(duì)結(jié)果顯著性的一個(gè)重要指標(biāo)...

根據(jù)基因列表，統(tǒng)計(jì)SV注釋文件中猎提，基因受到SV影響的數(shù)目 合并表格 R統(tǒng)計(jì)結(jié)果

按群體劃分

第一步 使用pbsv比對(duì) 第二步 第三步 群call

繪圖代碼

R代碼畫(huà)直的染色體分布圖 差異表達(dá)基因（RNA-seq）、開(kāi)放染色質(zhì)（DNase/ATAC-seq）伞租、CTCF結(jié)合位點(diǎn)（ChIP-seq）贞谓、突變...

采用的策略： 起始位置減去終止位置為標(biāo)記長(zhǎng)度葵诈，如果距離大于100kb裸弦，保留這一行，如果標(biāo)記是1或2作喘，下一個(gè)標(biāo)記(0理疙，來(lái)自親本1)的長(zhǎng)度小于100...