1. 代謝組數(shù)據(jù)示例(test_meta.txt) SampleID mws1401 A13 0.00 A16 0.00 A7 0.00 A17...
gatk --java-options "-Xmx185g -Djava.io.tmpdir=./tmp" HaplotypeCaller -R...
建立一個.inputrc文件夾 # /etc/inputrc - global inputrc for libreadline # See re...
1. 原因:利用gmaps回帖基因,會損失和錯誤很多渐尿,導(dǎo)致busco結(jié)果降低余指。所以可以直接基于掛載生成的agp文件直接進(jìn)行轉(zhuǎn)化捕犬,不損失任何基因。...
Mark一個很經(jīng)典的三維基因組學(xué)學(xué)習(xí)筆記 參考:https://geekdaxue.co/read/davey-brweo@xfltrm/ncf5i6
1. Hic數(shù)據(jù)mapping(Align Hi-C data to the assembly, remove PCR duplicates a...
plink --vcf All.input.vcf --biallelic-only --recode vcf-iid --out input....
問題1.因?yàn)閃GBS測序的原理是亞硫酸鹽處理會使未甲基化的胞嘧啶(C)被轉(zhuǎn)化為脫氨基胞嘧啶(T)碉碉,而甲基化的胞嘧啶(5-methylcytosi...
1.Bam2fq (by 森哥) 腳本如下: #!/usr/bin/perl =head1 Description ccsbam2fq.pl r...