請(qǐng)問一下結(jié)果第三列測(cè)序到的reads數(shù)目均為0是不是說明我前面質(zhì)控比對(duì)時(shí)出現(xiàn)了問題呀
2022-10-10 samtools分析測(cè)序基因組的depth和coverage對(duì)基因組測(cè)序完成后搪哪，我們經(jīng)常需要統(tǒng)計(jì)測(cè)序深度（depth）和對(duì)基因組的覆蓋率（coverage） 這兩個(gè)概念有時(shí)候不太好區(qū)分塔次，有時(shí)coverage也表示測(cè)序深度x. 我們用s...
一、簡(jiǎn)介 Samtools是一個(gè)用于操作sam和bam格式文件的應(yīng)用程序集合，具有眾多的功能。 它從SAM（序列比對(duì)/映射）格式導(dǎo)入和導(dǎo)出护姆，進(jìn)行排序，合并和索引掏击，并允許快速檢...
Coverage Depth 覆蓋深度 mapping depth 基因組被測(cè)序片段（短讀 short reads）“覆蓋”的強(qiáng)度有多大添祸？ 每一堿基的覆蓋率是基因組堿基被測(cè)序...
1 相關(guān)概念 測(cè)序深度（sequencing depth）=測(cè)得堿基數(shù)/reference堿基數(shù)，結(jié)果是n就是nX 覆蓋度（coverage, breadth of cove...
一、工作原理 新型納米孔測(cè)序法（nanopore sequencing）沐寺；采用電泳技術(shù)林艘。 Nanopore測(cè)序當(dāng)中的核心部件是這個(gè)由蛋白質(zhì)構(gòu)成的納米級(jí)的小孔，我...
文/雪憂 2018-12-13 我的舍友不努力究孕，我身邊的人卻在努力啥酱。 我的大學(xué)就是溫水煮青蛙，我就是懶惰的河草厨诸。 我的好朋友也在努力镶殷，我也不能再頹廢下去。 我的夢(mèng)想不能就此熄...
文|少女小漁 從學(xué)生時(shí)代，就總愛買書颗管，前幾天某衛(wèi)視翻拍《涼生陷遮，我們可不可以不憂傷》，一下子讓我想起高中那個(gè)時(shí)候垦江，因?yàn)殄X不夠帽馋，所以和閨蜜湊錢買這套書，我買一、三绽族，她買二姨涡、四。 ...
2018年還剩下最后的三周 有一句話不知道你聽過沒，說的是：“所有年底眼睛里的淚岁诉，都是年初腦子里進(jìn)的水“涎。” 所以涕癣，問題出在哪兒呢？ 是不是年初的目標(biāo)設(shè)定有問題前标？ 還是一年中執(zhí)...
上一篇文章，就簡(jiǎn)簡(jiǎn)單單寫了我對(duì)《洋蔥閱讀法》的一些簡(jiǎn)單感受稽犁，書中提到很有用的各種閱讀方法技巧焰望，我都沒有詳細(xì)說明，而這篇就介紹下這本書到底有什么值得我們可以借鑒的閱讀方法已亥。這些...
本月將第二次參加明月同學(xué)的行動(dòng)力訓(xùn)練營(yíng)虑椎，作為一個(gè)復(fù)訓(xùn)生震鹉，憑借著模糊的記憶和重復(fù)學(xué)習(xí)，在開課前先做一個(gè)復(fù)訓(xùn)筆記捆姜。讀書是學(xué)習(xí)的基礎(chǔ)传趾，認(rèn)知的門戶，那么怎樣快速讀一本書娇未，并做完有效的...
