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結(jié)構(gòu)變異SV的鑒定--smartie-sv與bayestyper
最近一直在折騰結(jié)構(gòu)變異SV的鑒定粹湃，SV的鑒定軟件雖然很多，但是在最近的兩篇基因組文章里面腺怯，主要用的是smartie-sv和bayesTyper毛嫉，...
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【pyhton報(bào)錯(cuò)】ModuleNotFoundError: No module named '_ctypes'
在安裝python的模塊時(shí)诽俯，報(bào)以上錯(cuò)誤，需要安裝libffi包承粤。 libffi的安裝 安裝完之后暴区，一定要把libffi的lib和include加...
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【降解組分析】利用CleaveLand4進(jìn)行降解組分析
降解組的分析，目前主流的軟件為CleaveLand4辛臊，他可以通過(guò)測(cè)序數(shù)據(jù)來(lái)尋找miRNA與基因的剪切位點(diǎn)仙粱，從而驗(yàn)證miRNA靶基因的準(zhǔn)確性。 C...
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用tbtools進(jìn)行基因家族分析《三》基因的染色體定位分析 利用tbtools的 Gene Location Visualize From GTF/GFF工具彻舰，對(duì)染色體進(jìn)行位置的繪制...
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用tbtools進(jìn)行基因家族分析《二》家族成員的確定 找到 ”Batch-CDD"工具伐割，輸入上一步獲得的hitdata.txt文件，以及蛋白序列文件刃唤，點(diǎn)擊"start“隔心，對(duì)其結(jié)構(gòu)進(jìn)行...
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用tbtools進(jìn)行基因家族分析《一》此版本為無(wú)代碼版本，依賴tbtools來(lái)實(shí)現(xiàn)尚胞，純粹記錄自己的學(xué)習(xí)經(jīng)驗(yàn)硬霍。 蛋白序列的blast比對(duì) 選擇擬南芥基因家族的蛋白序列文件 選擇你想要查...
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【R語(yǔ)言】parallel實(shí)現(xiàn)多線程
由于最近用R語(yǔ)言跑的數(shù)據(jù)比較多，且都是重復(fù)的操作辐真，跑一次時(shí)間長(zhǎng)须尚，所以嘗試了下并行運(yùn)算，所用的包為 parallel 侍咱，使用簡(jiǎn)單耐床，易于上手。 pa...
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SraToolkit工具下載與安裝
@[TOC](SraToolkit 下載與安裝) 第一步：進(jìn)入NCBI選擇“Download”, 進(jìn)入后選擇“Download Tools”工具...