發(fā)簡信
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2020-04-11
博客主頁： 目前簡書已經不再更新蚂蕴，有興趣的同學可以關注個人博客主頁：https://chenhongyubio.github.io/
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基因家族分析全套軟件
基因家族生物信息學分析 （1）基因家族分析概述 旁系同源基因 基因家族可通過基因復制進行物種特異性擴增鳞骤，主要有染色體片段復制龄减、串聯(lián)復制和反轉錄子...
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玫瑰圖繪制
雷達圖繪制 （1）ggplot2簡約版雷達圖 library(ggplot2) dt = data.frame(A2 = c(0, 3.33, ...
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單細胞轉錄組擴增技術
單細胞轉錄組測序方法詳解 1 Smart-seq2（擴增全長轉錄組） 通過ployT抓取，只能檢測mRNA。 Smart-seq2步驟: 1通過...
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edgeR
edgeR 主要是利用了多組實驗的精確統(tǒng)計模型或者適用于多因素復雜實驗的廣義線性模型。 前者叫做“經典edgeR”， 后者叫做”廣義線性模型 e...
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WGCNA代碼
WGCNA rm(list = ls()) #加載R包 library(WGCNA) library(tidyr) library(ggplot...
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HMMER3.1軟件使用
HMMER3.1軟件的使用 HMMER3.1官方下載地址：http://hmmer.org/download.html咸灿。 HMMER3.1使用手...
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轉錄組數(shù)據(jù)標準化--Normalization轉錄組數(shù)據(jù)經過比對到參考基因組獲得對應基因count值后，因為測序深度以及基因長度的關系侮叮，在進行差異分析之前避矢，還需要進行標準化。標準化是轉錄組數(shù)...
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Augustus
在基因組注釋中签赃，預測基因結構是最核心的一環(huán)谷异，在眾多的從頭預測軟件中，augustus應用較廣锦聊。但是由于安裝過程依賴軟件較多歹嘹，如果沒有管理員權限一...