發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：陜西
-
文獻(xiàn)閱讀集錦 | 泛基因組
2023 年 Nature Genetics | 橙超級(jí)泛基因組揭示柑橘屬和柑橘亞科植物起源并鑒定調(diào)控果實(shí)檸檬酸積累的關(guān)鍵基因[https://...
-
11 篇 Science 連發(fā)！解析基因組的關(guān)鍵之處，揭示人類(lèi)健康和疾病的相關(guān)信息導(dǎo)讀 從兩克重的大黃蜂到重達(dá)數(shù)噸的鯨魚(yú)竞阐，地球上存在著包括人類(lèi)在內(nèi)的豐富的物種齐饮，在過(guò)去的漫長(zhǎng)時(shí)間里商佑，它們幾乎適應(yīng)了地球上的所有環(huán)境酌媒。其中拥娄，哺乳動(dòng)物...
-
MODA創(chuàng)刊號(hào)｜未來(lái)農(nóng)業(yè)的100個(gè)重要問(wèn)題在農(nóng)業(yè)問(wèn)題上候齿，世界正處于一個(gè)十字路口熙暴。全球人口持續(xù)增長(zhǎng)，對(duì)食品的需求也在不斷增加慌盯，這給我們的農(nóng)業(yè)資源和實(shí)踐帶來(lái)了巨大壓力和挑戰(zhàn)周霉。因此，我們?cè)谌?..
-
scRNA-Seq | 多樣本Seurat+CCA整合一亚皂、前言 左邊的圖簡(jiǎn)單地把多個(gè)單細(xì)胞的數(shù)據(jù)合并在一起俱箱，不考慮去除批次效應(yīng)，樣本之間有明顯的分離現(xiàn)象灭必。右邊的圖是使用算法校正批次效應(yīng)狞谱，不同的樣本基...
-
scRNA-Seq | 單細(xì)胞亞群合并與提取本文涉及：亞群合并乃摹，亞群提取，亞群細(xì)分跟衅，亞群抽樣 一般來(lái)講孵睬，不同亞群的細(xì)胞具有不同的功能，因此亞群分析對(duì)于研究十分重要伶跷，會(huì)影響后續(xù)分析結(jié)果掰读。 進(jìn)...
-
scRNA-Seq | SCENIC 推斷基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和細(xì)胞類(lèi)型轉(zhuǎn)錄因子 (transcription factors, TFs) 是直接作用于基因組，與特定DNA序列結(jié)合 (TFBS/motif) 叭莫，調(diào)控D...
-
scRNA-Seq | Seurat的三種單細(xì)胞數(shù)據(jù)整合方法匯總（批次校正）
適用背景 單細(xì)胞數(shù)據(jù)由于實(shí)驗(yàn)平臺(tái)或樣本等原因會(huì)造成不同數(shù)據(jù)集之間存在批次效應(yīng)磷支，這種批次效應(yīng)是人為因素造成的，沒(méi)有實(shí)際的生物學(xué)意義食寡，可能對(duì)研究結(jié)果...
-
scRNA-Seq | Seurat 打通單細(xì)胞常規(guī)流程Seurat standard pipeline(10核心流程) 創(chuàng)建Seurat對(duì)象 Read10X CreateSeuratObjecet質(zhì)...
-
scRNA-Seq | Seurat 包原理解析seurat 涉及的數(shù)據(jù)分析包括很多步驟。之前只顧著干活兒廓潜，也沒(méi)有系統(tǒng)的整理過(guò)分析中的具體內(nèi)容抵皱。這里就參照網(wǎng)上大神們分享的帖子，來(lái)梳理一下辩蛋。 一...