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使用gatk進(jìn)行SNPCalling及下游分析（BSA等）
1 二代數(shù)據(jù)過(guò)濾（現(xiàn)在二代數(shù)據(jù)質(zhì)量較高蘸炸，可不過(guò)濾） 使用fastp過(guò)濾馅笙，參數(shù)默認(rèn) fastp -w 30 -i ${i}_1.fq.gz -I ...
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Word和WPS插入和修改目錄1 Word插入目錄 以上面格式為參考： 在Word中首先要對(duì)確定每一章標(biāo)題的大綱級(jí)別 1 將光標(biāo)放置在第一章的位置愉择，右鍵段落寨腔，選擇大綱級(jí)別锥债，改...
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利用Verkko組裝基因
Verkko是一款能夠?qū)iFi和ONT數(shù)據(jù)進(jìn)行混裝的工具玖瘸，是一款可以用于T2T組裝的工具驾窟。 1 Verkko安裝比較簡(jiǎn)單比驻，利用conda可直接...
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計(jì)算多個(gè)突變體中突變基因（并集）的數(shù)目
#計(jì)算突變體中的pan基因 import sys from itertools import combinations input1 = ope...