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參考:https://blog.csdn.net/zx_zhang01/article/details/120222212[https://bl...
最近開始對重測序數(shù)據(jù)進行分析认烁,針對構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹做記錄:進入環(huán)境: 文件準(zhǔn)備:SNP的.vcf文件軟件準(zhǔn)備:bgzip(壓縮為gz格式)烟央、bcf...
利用grep+wc命令 之后會出來該序列在基因組文件中出現(xiàn)的次數(shù)疟丙。特異的話是1
應(yīng)用軟件:samtools(獲得染色體全長信息)呻此、bwa(建立索引)塘雳、GATK(變異查找與基因分型骤星,需要安裝jdk8)吃沪、seqkit(fasta...
原文鏈接:https://blog.csdn.net/pdsu161530247/article/details/81582980版權(quán)聲明:本文...
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