我們前面四次教程锨络，已經(jīng)完成單細(xì)胞數(shù)據(jù)的預(yù)處理了急迂，包括質(zhì)控称龙，歸一化晤郑，高可變基因篩選书斜，降維∧到瑁現(xiàn)在伦连，我們就要開始單細(xì)胞測序的正式分析了雨饺，細(xì)胞類型注釋等...

前言提到，在過去兩天的教程中惑淳，我們講解了使用omicverse進(jìn)行單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)的預(yù)處理的一些思想额港。關(guān)于omicverse的使用文檔與安裝教程可...

前言提到，在過去兩天的教程中歧焦，我們講解了使用omicverse進(jìn)行單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)的質(zhì)控以及歸一化的一些思想移斩。關(guān)于omicverse的使用文檔與安...

1. 背景 在前面的教程中，我們從數(shù)據(jù)集中刪除了低質(zhì)量的細(xì)胞绢馍，包括計(jì)數(shù)較差以及雙細(xì)胞向瓷，并將數(shù)據(jù)存放在anndata文件中。由于單細(xì)胞測序技術(shù)的限...

目前舰涌，國內(nèi)對于單細(xì)胞測序分析的教程五花八門猖任，百花齊放，一個(gè)合適且準(zhǔn)確的pipeline對于分析是很有價(jià)值的瓷耙。2023年在 Nat Rev Gen...

在前面的教程中朱躺，我們介紹了使用omicverse完成基本的RNA-seq的分析流程，在本節(jié)教程中哺徊，我們將介紹如何使用omicverse完成加權(quán)基...

Bulk RNA-seq 分析的一個(gè)重要任務(wù)是分析差異表達(dá)基因室琢，我們可以用 omicverse[https://github.com/Starl...

Bulk RNA-seq 分析的一個(gè)重要任務(wù)是分析差異表達(dá)基因，我們可以用 omicverse[https://github.com/Starl...

2023年6月7日落追，來自北京科技大學(xué)盈滴，清華大學(xué)與中山大學(xué)的研究者在biorxiv上發(fā)布了一篇題為“OmicVerse: A single pip...