發(fā)簡信
IP屬地：河北
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根據(jù)已有序列提純二三代測序數(shù)據(jù)
提純二代數(shù)據(jù) 提純?nèi)鷶?shù)據(jù)
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FG12組裝注釋全過程測序： RNA-seq：100Xnanopore：80Xresequence：30X 質(zhì)控： 使用fastp對RNAseq和Resequence...
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數(shù)據(jù)表達定量比對軟件：hisat2 比對率至少70% 飽和性曲線：20M reads數(shù)據(jù)量即可檢測到80%數(shù)據(jù)量堿基數(shù)目：（150+150）X20M（r...
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antiSMASH數(shù)據(jù)庫：微生物次生代謝物合成基因組簇查詢和預測臨床上使用的大部分抗生素和藥物均來自植物或微生物的天然產(chǎn)物洼专。結(jié)合基因組挖掘的經(jīng)典分離與分析法使得基于基因組的天然產(chǎn)物途徑鑒定和描述更為方便恳谎。 a...
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2020-05-05使用SignalP對蛋白序列進行信號肽預測
信號肽簡介信號肽是蛋白質(zhì)N-末端一段編碼長度為5-30的疏水性氨基酸序列逼裆，用于引導新合成蛋白質(zhì)向通路轉(zhuǎn)移的短肽鏈悼凑。信號肽存在于分泌蛋白、跨膜蛋白...
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禾谷鐮刀菌轉(zhuǎn)錄組分析--準備數(shù)據(jù)1狈谊、準備數(shù)據(jù)：測序數(shù)據(jù)和參考基因組測序數(shù)據(jù)：NCBI中SRA數(shù)據(jù)庫登刺，Accession: PRJNA522013 ASPERA，類似下載加速器爱葵，...
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2020-03-17合并矩陣： 輸入：每個樣本定量結(jié)果施戴，輸出：reads.count矩陣（gene_count.matrix）用于差異分析反浓，標準化后的矩陣(tpm....
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2018-09-03第一天 數(shù)據(jù)下載https://sra-explorer.info/? 流程：全部選中--add to collection--saved da...