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STOmics-seq：Stereopy教程（二）本期內(nèi)容展示Stereopy的Cell Bin的處理蚀瘸，即bin1的時(shí)候的教程 一剂碴、代碼教程 1阳柔、讀取數(shù)據(jù)生成 StereoExpData 對象 ...
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STOmics-seq：Stereopy教程（一）一、背景介紹 大家其實(shí)對華大測序的原理什么的都知道搪锣，但是以下概念是比較重要的秋忙，什么是DNB，bin构舟，我們怎么選擇binsize的大小等問題就至關(guān)...
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R包安裝時(shí)報(bào)錯(cuò) package xxx is not available (for R versionXXX)
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單細(xì)胞量化代謝活性-scMetabolism一灰追、scMetabolism的安裝 scMetabolism是一個(gè)R包堵幽，用于在單細(xì)胞分辨率下量化代謝活性，目前只適用于物種是人的單細(xì)胞數(shù)據(jù)弹澎。作者...
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一文學(xué)會(huì)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的CellRanger（一）一朴下、什么是Cell Ranger？ Cell Ranger 是一組分析管道苦蒿，用于處理 Chromium 單細(xì)胞數(shù)據(jù)殴胧，將fastq原始數(shù)據(jù)經(jīng)過比對...
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ChIP-Seq——MAnorm差異分析
一、 MANorm介紹 MAnorm是一個(gè)穩(wěn)健的模型佩迟，用于定量比較 TF（轉(zhuǎn)錄因子）或表觀遺傳修飾的 ChIP-Seq 數(shù)據(jù)集团滥。MAnorm 使...
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單細(xì)胞免疫組庫VDJ——scRepertoire （四）一、介紹 scRepertoire 旨在從 10x Genomics Cell Ranger 管道中獲取過濾器 contig 輸出报强，處理該數(shù)據(jù)以...
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非模式物種KEGG富集數(shù)據(jù)庫準(zhǔn)備（二）一灸姊、KEGG數(shù)據(jù)下載 1、先進(jìn)入官網(wǎng)：https://www.kegg.jp/[https://www.kegg.jp/] 2秉溉、進(jìn)入KO (KE...