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  • linux下批量修改文件名

    實(shí)現(xiàn)方式一通過正則替換對應(yīng)的字段之后mv,實(shí)現(xiàn)修改文件名稱: 例1:批量替換fastq.gz的名稱為fastq: 例2:批量替換fastq.gz...

  • 提升IGV打開文件速度

    在使用IGV展示測序深度時梯码,可以用igvtools先計算出tdf文件再導(dǎo)入IGV中宝泵,這樣比直接導(dǎo)入bam文件快很多。在tdf文件中轩娶,其測序深度和...

  • sam和bam文件處理

    samtools是一個用于操作sam和bam文件的工具合集儿奶。包含有許多命令。以下是常用命令的介紹:sambamba是一個比samtools更強(qiáng)大...

  • sed鳄抒、awk闯捎、perl混合實(shí)現(xiàn)同樣的功能——文本轉(zhuǎn)換和替代

    Unix 環(huán)境:轉(zhuǎn)換DOS 的新行符(CR/LF)為Unix 格式搅窿。 Unix 環(huán)境:轉(zhuǎn)換Unix 的新行符(LF)為DOS 格式。 DOS 環(huán)...

  • sed隙券、awk男应、perl混合實(shí)現(xiàn)同樣的功能——編號

    為文件中的每一行進(jìn)行編號(簡單的左對齊方式)。這里使用了“制表符”(tab娱仔,見本文末尾關(guān)于’\t’的用法的描述)而不是空格來對齊邊緣沐飘。 對文件中...

  • sed、awk牲迫、perl混合實(shí)現(xiàn)同樣的功能——文本間隔

    在每一行后面增加一空行 將原來的所有空行刪除并在每一行后面增加一空行耐朴。 這樣在輸出的文本中每一行后面將有且只有一空行。 在每一行后面增加兩行空行...

  • docker介紹

    docker相關(guān)的概念: 鏡像:把操作系統(tǒng)盹憎、軟件筛峭、環(huán)境變量打包成一個包,就是鏡像陪每,在鏡像里面影晓,類似一個虛擬機(jī)。 倉庫:存儲鏡像的地方 鏡像 用來...

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半個程序猿檩禾,半個生物員挂签。
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