搜尋數(shù)據(jù)集及下載數(shù)據(jù) 差異分析--->差異表達(dá)基因 --->五大數(shù)據(jù)庫注釋--->蛋白互作等網(wǎng)絡(luò)和通路注釋 今天先為大家分享第一步“數(shù)據(jù)下載”锨推,...
GFF和GTF是兩種最常用的數(shù)據(jù)庫注釋格式座韵,在信息分析中建庫時除了需要fasta文件一般還會需要這兩種文件,提取需要的信息進(jìn)行注釋堤舒。Cuffli...
參考:http://www.reibang.com/p/1bc986ee1a9e[http://www.reibang.com/p/1bc9...
轉(zhuǎn)載自:https://mp.weixin.qq.com/s/VxAOXz-jueAgbYdbdASAUw http://www.bioon.c...
串聯(lián)法和并聯(lián)法構(gòu)建進(jìn)化樹 串聯(lián)法(Concatenation):先將不同物種之間的每個單拷貝基因單獨進(jìn)行多序列比對色建,然后將這些比對后的單拷貝基因...
下載目標(biāo)物種的蛋白質(zhì)組序列 使用哪個蛋白質(zhì)組版本 OrthoFinder 使用蛋白質(zhì)編碼基因的氨基酸序列。這通常位于物種的文件夾中舌缤,稱為“注釋”...
安裝orthofinder 使用conda安裝 安裝軟件前箕戳,先設(shè)置一個小環(huán)境,不要直接在自己賬戶的當(dāng)前環(huán)境內(nèi)安裝軟件国撵;你可以創(chuàng)建很多小環(huán)境名陵吸,...
下載最新版本的linux版示例:wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/mi...
退出 conda base 虛擬環(huán)境回到系統(tǒng)環(huán)境 conda activate and conda deactivate only work o...