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S?rensen 指數(shù)和 Jaccard 指數(shù)作為配對樣方間β 多樣性的度量沃但,使用 Baselga 在 2010 和 2012 年提出的 β 多...
數(shù)據(jù)準(zhǔn)備(數(shù)據(jù)為矩陣的表格): 構(gòu)建點邊文件: 繪制圖形 @西北工作室(TB)
準(zhǔn)備數(shù)據(jù) 如下圖: 利用ggplot2進(jìn)行可視化
網(wǎng)絡(luò)圖 共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)是研究突出了不同環(huán)境下微生物群落間的相互作用模式重要方式佛吓,可以從網(wǎng)絡(luò)角度理解微生物群落共現(xiàn)特征宵晚,包括分析不同生境下微生物之間相互...
采用ggplot2繪制誤差線需要對數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換求得mean和sd(或se等)辈毯,可以通過superb包superbPlot函數(shù)一步到位法坝疼,下面以Too...
生態(tài)位寬度(Bi)采用Colwell等(1971)加權(quán)修正的Levins指數(shù) 式中搜贤,Bi為物種i的生態(tài)位寬度值谆沃,其范圍在[0-1]之間,值越大說...