240 發(fā)簡(jiǎn)信
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  • biostar第八課 Blast

    Blast Blast有好幾個(gè)工具社证,blastn,blastp,blastx還有tblastn,tblastx blast 是干啥的 就是你有一...

  • Biostar 第七課01 模式識(shí)別

    模式識(shí)別的bash工具 grep egrep dreg 和 fuzznuc 通配符{m,n} 前面的字母出現(xiàn)次數(shù)在m和n之間 尋找基因組中的端粒...

  • Biostar第七課02 align到基因組

    這個(gè)是重點(diǎn)中的重點(diǎn),雖然是最基礎(chǔ)的,但是這個(gè)的結(jié)果將直接影響下游的多種分析,可以說(shuō)是核心文件。 怎樣去選擇參數(shù),這個(gè)貌似要看自己的觀點(diǎn)所意,其實(shí)就是...

  • Biostar第六課 測(cè)序儀和QC

    454測(cè)序是第一個(gè)出來(lái)的二代測(cè)序,但是現(xiàn)在沒(méi)人用了催首,因?yàn)閿?shù)據(jù)處理太復(fù)雜扶踊,而且由于不是很普及,所以大家都沒(méi)有心情去開(kāi)發(fā)軟件郎任,現(xiàn)在的都是老版的軟件了...

  • 4.1 biostar第四課 gene ontology

    Gene Ontology 解決兩件事 注釋?zhuān)@個(gè)基因是啥 功能秧耗,這個(gè)基因干啥 定義人類(lèi)基因名的權(quán)威組織HUGO,我看到這里的時(shí)候一度懷疑這個(gè)組...

  • 5 Biostar 第五課 FASTA和FASTQ格式

    Fasta 和 Fastq格式作為測(cè)序分析的基礎(chǔ)舶治,絕對(duì)是重中之重分井,所以了解這兩個(gè)文件的構(gòu)成和格式就非常重要 Fasta格式 以 > 為heade...

  • 3.2 bash 命令

    以下內(nèi)容主要摘抄自上課課件,非本人原創(chuàng) $(<filename) 可以用file里面的內(nèi)容替代整個(gè)的$(...) 內(nèi)容$(command) 用命...

  • 3.1 biostar lesson3 linux學(xué)習(xí)日記;java版本;awk

    又學(xué)一招霉猛,來(lái)自組織的微信群如果.bashrc 無(wú)法保存尺锚,解決方案刪掉.swp刪掉.bashrc.bak就OK conda 查看當(dāng)前環(huán)境下,都安裝...

  • 2 Biostar lesson 2 基礎(chǔ)生物知識(shí)和計(jì)算機(jī)設(shè)置

    基礎(chǔ)生物學(xué)知識(shí) 這部分的內(nèi)容基本就是介紹了分子生物學(xué)的基本知識(shí)點(diǎn)惜浅,DNA瘫辩,RNA以及蛋白這些個(gè)傳統(tǒng)的中心法則上面的三個(gè)大面。然后介紹了基因組以及...

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