常用的分析方法: 過表征分析 (over representation analysis, ORA) :先找出差異基因腻格,再對差異基因進行如GO/KEGG等富集 基因富集分析 ...
??R是一個驚艷的圖形構建平臺,這也是R語言的強大之處啥繁。本文將分享R語言簡單的繪圖命令菜职。??本文所使用的數據或者來自R語言自帶的數據(mtcars)或者自行創(chuàng)建。??首先旗闽,讓...
在本次練習中酬核,我們通過一個簡單的例子蜜另,快速了解ggplot2作圖的思想。 1.ggplot2的安裝 通過以下命令嫡意,安裝ggplot2包 2.數據的準備 在ggplot繪圖的藝...
最近用之前寫的R腳本重新跑數據時举瑰,出現了報錯。經檢查蔬螟,才發(fā)現是數據的列名讀入R時發(fā)生了變化此迅,列名前自動加上了X.符號。 read.table系列函數有一個check.name...
geom_line: 按變量在x軸上的順序連接 geom_path: 按變量在數據中出現的順序連接 折線圖的美學映射有: x y group alpha size linet...
1. 條形圖 語法在R語言中創(chuàng)建條形圖的基本語法是 - 以下是所使用的參數的描述 --- H是包含在條形圖中使用的數值的向量或矩陣旧巾。-- xlab是x軸的標簽耸序。-- ylab...
感覺100年沒有上簡書鲁猩,近2個月忙于畢業(yè)論文以及公眾號推文坎怪,沒有時間更文章。終于前幾天交了論文呢廓握,可以回來更文了搅窿。沒錯我只是在為我的懶惰尋找接口,今天我們來講一下杉部茫基圖(Sa...
在ceRNA相關的研究中是尔,例如circRNA-miRNA-mRNA殉了,或者lncRNA-miRNA-mRNA的靶向關系圖譜,一般通過網絡圖呈現拟枚。首先可以肯定的是薪铜,網絡圖是一種清...
本文使用某宏基因組測序數據中的種水平類群豐度表脚乡,并直接根據所有種相對豐度總和蜒滩,提取出top10豐度的種類群,作圖展示這些種的豐度組成奶稠,top10外的類群合并為“Others”...