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  • 你好，用stringtie不做組裝得到merge.gtf,而直接用已有的gtf注釋文件，就可以得到基因的FPKM和TPM定量了嗎？

    關(guān)于stringtie定量基因的時(shí)候，最后輸出很多MSTRG樣式的geneid

    相信大家在用hisat2-stringtie-DESeq2這一套流程做差異表達(dá)基因分析的時(shí)候的時(shí)候律歼，最后會(huì)輸出很多帶MSTRG字樣的geneid。 我一開(kāi)始搜索這個(gè)問(wèn)題，...

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    SAMtools: SAM格式的處理利器

    SAM及其相關(guān)工具 SAM格式介紹 SAM全稱是Sequence Alignment/Map, 是目前最常用的存放比對(duì)或聯(lián)配數(shù)據(jù)的格式梳杏。無(wú)論是重測(cè)序韧拒，還是轉(zhuǎn)錄組，還是表觀組秘狞，...

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