BEAM分析那里我的報(bào)錯(cuò)
Error in if (progenitor_method == "duplicate") { :
the condition has length > 1
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組基礎(chǔ)分析六：偽時(shí)間分析本文是參考學(xué)習(xí)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組基礎(chǔ)分析六：偽時(shí)間分析[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyMzMwNDQ2MA==&mid=22474837...
lung <- load_lung()#報(bào)錯(cuò)倒脓，請(qǐng)問(wèn)是什么原因呢铐伴？
Error in if (isSparseMatrix(counts)) { : the condition has length > 1
In addition: Warning message:
In class(cellData) != "matrix" && isSparseMatrix(cellData) == FALSE :
'length(x) = 2 > 1' in coercion to 'logical(1)'
Monocle2包學(xué)習(xí)筆記（四）：Differential Expression Analysis差異基因表達(dá)分析是RNA-Seq實(shí)驗(yàn)中的常見(jiàn)任務(wù)，Monocle2可以幫助我們找到在不同組細(xì)胞之間差異表達(dá)的基因缨伊，并評(píng)估這些基因差異表達(dá)變化的統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。 Basic Dif...
作者您好辣卒，請(qǐng)問(wèn)分支分析那里出現(xiàn)這樣報(bào)錯(cuò)的原因是什么呢拧晕？
> BEAM_res <- BEAM(monocle_cds, branch_point = 1, cores = 4) ###選擇branch_point =1。
Error in if (progenitor_method == "duplicate") { :
the condition has length > 1
monocle分析及結(jié)果解讀1.寫(xiě)在前面的話： 近年來(lái)蜒茄，由于細(xì)胞的異質(zhì)性及發(fā)育分化等相關(guān)的問(wèn)題越來(lái)越被研究者們所關(guān)注唉擂，單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析為研究異質(zhì)細(xì)胞群的復(fù)雜生物學(xué)過(guò)程提供了方法和工具。每一個(gè)細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)錄...
10xGenomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組 10xGenomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析的核心就是聚類(lèi)檀葛，但是單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析的聚類(lèi)到目前為止還存在很多困難和挑戰(zhàn)玩祟，具體可以參考文獻(xiàn)Chall...
您好，請(qǐng)問(wèn)您的問(wèn)題解決了嗎屿聋？我也碰到同樣的問(wèn)題
單細(xì)胞之軌跡分析-2：monocle2 原理解讀+實(shí)操軌跡分析系列： 單細(xì)胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.reibang.com/p/ee0f7a8e6a06] 擬時(shí)間序列分析（Pseudot...
作者您好空扎，請(qǐng)問(wèn)分支分析那里BEAM出現(xiàn)這樣的報(bào)錯(cuò)是什么原因呢？
> BEAM_res <- BEAM(monocle_cds[gene_to_check,], branch_point = 1, cores = 2)
Error in if (progenitor_method == "duplicate") { :
the condition has length > 1
單細(xì)胞之軌跡分析-2：monocle2 原理解讀+實(shí)操軌跡分析系列： 單細(xì)胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.reibang.com/p/ee0f7a8e6a06] 擬時(shí)間序列分析（Pseudot...
請(qǐng)問(wèn)用什么方法可以把小提琴圖的中值數(shù)值顯示出來(lái)润讥？
10xGenomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄seurat包提取表達(dá)量畫(huà)小提琴圖10xGenomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄seurat包提取表達(dá)量畫(huà)小提琴圖 需求提取表達(dá)畫(huà)小提琴圖對(duì)噪音處理 需求 其實(shí)seurat包已經(jīng)有畫(huà)小提琴圖的函數(shù)勺卢，VlnPlot，參數(shù)也較...
#指定基因
s.genes <- c("SELL","CCR7","IL7R", "CD84","CCL5","S100A4")
p1 <- plot_genes_jitter(cds[s.genes,], grouping = "State", color_by = "State")
這個(gè)地方會(huì)出現(xiàn)
Error in intI(i, n = x@Dim[1], dn[[1]], give.dn = FALSE) :
invalid character indexing
這樣的報(bào)錯(cuò)象对，請(qǐng)問(wèn)是怎么回事呢
單細(xì)胞之軌跡分析-2：monocle2 原理解讀+實(shí)操軌跡分析系列： 單細(xì)胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.reibang.com/p/ee0f7a8e6a06] 擬時(shí)間序列分析（Pseudot...
輸入文件導(dǎo)入方法 Monocle擬時(shí)間導(dǎo)入數(shù)據(jù)方式有兩種勒魔，一種是通過(guò)導(dǎo)入Seurat對(duì)象甫煞，一種是導(dǎo)入cellranger輸出的表達(dá)矩陣（三個(gè)文件barcodes.tsv g...
請(qǐng)問(wèn)報(bào)錯(cuò)信息顯示R1文件里面 line: 770355964: corrupt deflate stream 是什么原因呢抚吠？
10X cellranger 報(bào)錯(cuò)解決辦法越來(lái)越多的同學(xué)開(kāi)始自己嘗試做10X單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析了，除了Linux的基本命令之外弟胀，首先用到的軟件是cellranger楷力。失敗是成功之母喊式，對(duì)一個(gè)新手來(lái)講很可能會(huì)遇到這樣那...
