發(fā)簡(jiǎn)信
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transvar坐標(biāo)轉(zhuǎn)換
有時(shí)候我們拿到變異位點(diǎn)的基因組坐標(biāo)之后，往往想看它的轉(zhuǎn)錄本坐標(biāo)或氨基酸坐標(biāo)以便跟已知變異位點(diǎn)進(jìn)行比較，transvar就可以輕輕松松實(shí)現(xiàn)坐標(biāo)轉(zhuǎn)換...
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三 docker 容器基本命令
1热监、查看當(dāng)前運(yùn)行容器docker ps2弹渔、啟動(dòng)撬即、查看容器標(biāo)準(zhǔn)輸出docker run -v computer_dir/:docker_dir/ ...
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二docker鏡像基本命令
1姆涩、列出本地鏡像docker images2账忘、下載鏡像docker pull ubuntu:latest其中 ubuntu代表鏡像名，lates...
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一docker基本概念對(duì)于生信人員來(lái)說(shuō)佑吝，最頭疼的應(yīng)該算是更換計(jì)算資源了坐昙，這就意味著你之前流程的所有軟件環(huán)境都需要在新的服務(wù)器上重新部署一次，真是費(fèi)時(shí)又費(fèi)勁芋忿。而dock...
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四R 4.1 docker 構(gòu)建
R包的安裝往往令人頭疼民珍，總是會(huì)遇到各種各樣的問(wèn)題，雖然conda 安裝R盗飒，使得R包安裝有了些許方便嚷量，但有些時(shí)候 conda更改了真正的環(huán)境路徑，...
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dump—HiTC我們知道.hic 文件是高度壓縮的二進(jìn)制文件逆趣，便于存儲(chǔ)和分析蝶溶。那么如果我們想要從.hic提取某一區(qū)域的交互信息的話，該如何操作呢宣渗？這就涉及到了j...
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loop 可視化未寫(xiě)完......
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【單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組】獲取 monocle2 branchpoints我們知道m(xù)onocle2 最重要的一個(gè)分析是對(duì)分支進(jìn)行差異分析（如下圖） 經(jīng)典的教程總是： 那如果我的分支并非只有一個(gè)而是多個(gè)抖所，我怎么批量化分析...
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【生信基礎(chǔ)】conda 安裝R和R包
conda 安裝R環(huán)境，主要命令如下： conda 創(chuàng)建R環(huán)境 2.激活創(chuàng)建的環(huán)境,后面安裝的包和軟件都會(huì)在此環(huán)境中進(jìn)行 3.安裝所需要的包 4...