如何計算r^2降到0.2時的值呢咆畏?是從Out.bin.gz里面自己找值嗎吴裤?
10.GWAS:LD decay(LD衰減)—— PopLDdecay關于連鎖不平衡的詳細介紹在之前的帖子里有說過,這里就不再贅述枕面,本篇主要介紹LD decay的計算。1.GWAS:原理與目的 - 簡書 (jianshu.com)[https:...
官方網(wǎng)站:https://itol.embl.de/[https://itol.embl.de/] ITOL是Interaction Tree Of Life(網(wǎng)址:http...
還是老習慣碌嘀,給出官網(wǎng)教程,至于你是看還是不看歪架,它就在那里股冗,等著你的深入研究~ https://horvath.genetics.ucla.edu/html/Coexpress...
WGCNA分析基于兩個假設:1.相似表達模式的基因可能存在共調控、功能相關或處于同一通路和蚪,2.基因網(wǎng)絡符合無尺度分布止状。基于這兩點惠呼,可以將基因網(wǎng)絡根據(jù)表達相似性劃分為不同的模塊...
WGCNA的原理如果不掌握的話旅薄,就很難在做WGCNA分析的過程中,利用手中的代碼去修改參數(shù)泣崩,就無法得到滿意的圖圖少梁。所以,下面放幾篇文獻中的WGCNA的流程圖矫付,供參考 然后放上...
致知 2019-10-06一起為你的基因找個朋友吧~ 上一次學習WGCNA還是7月份做小組作業(yè)的時候,本來想做WGCNA买优,但是當時各方面沒有入門妨马,理解不了這個是個啥東西,最后...
目的:對群體結構和親緣關系進行評估以確定使用的統(tǒng)計模型和獲得相應的矩陣 評估內容(遺傳上差異過大應剔除滤淳,相似性高的保留其一) Structure是與PCA、進化樹相似的方法砌左,...