2016年夏，我進(jìn)入到Genentech公司進(jìn)行實(shí)習(xí)操灿，這是一家在南舊金山的世界上最大的生物制藥公司俯画。公司在2009年被羅氏收購排抬，目前是羅氏在北美...

2019年第一天，我載著大寶和豆包以及剩余家當(dāng)從洛杉磯搬到灣區(qū)辱魁。我們住的房子烟瞧，由于客廳住著房東诗鸭，常年是不開燈的染簇，我們需要摸黑走過狹長(zhǎng)的走道，到達(dá)...

昨天發(fā)現(xiàn)了神器multiqc來整合分析一個(gè)目錄下所有文件的quality control結(jié)果强岸，今天來試著裝了一下锻弓。 然后又發(fā)現(xiàn)了conda這個(gè)使...

之前一直用的是Tophat + Htseq-count + Deseq2的分析組合來做rnaseq的回帖妓盲，確定基因表達(dá)量杂拨，以及做差異基因的分析。...

有時(shí)候會(huì)有這樣的分析需求悯衬，拿到兩個(gè)基因弹沽，或者兩個(gè)基因list，雖然它們是不同的基因的，但是可以提一個(gè)問題策橘，它們之間的功能注釋上有沒有相似性呢炸渡？ ...

Gene ontology enrichment analysis可能是現(xiàn)在生物信息學(xué)里面最常用的分析。以前我一般都是用DAVID這個(gè)在線工具來...

org.Hs.eg.db This is a package for genome-wide annotation for human, hav...

做生物信息算下來七八年了丽已，中間會(huì)遇到許多的問題以及學(xué)習(xí)后的解決方案蚌堵，許多都沒有記錄下來，這是一個(gè)非常遺憾的事情沛婴。 之前用了一段時(shí)間博客吼畏，比如wo...