IP屬地：吉林
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Ubuntu Server安裝及配置下載準(zhǔn)備 UltraISO下載突梦，Ubuntu Server iso下載 啟動(dòng)盤制作 啟動(dòng)UltraISO任连，打開Ubuntu iso文件，寫入硬盤...
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RNA-seq無(wú)比對(duì)直接定量(Kallisto - sleuth流程)RNA-seq數(shù)據(jù)下載 數(shù)據(jù)來(lái)自文獻(xiàn)：An RNA-Seq transcriptome and splicing database of neu...
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Reanalysis of mouse ENCODE mRNA-seq前言 ENCODE項(xiàng)目團(tuán)隊(duì)發(fā)表在PNAS上的文章表示：通過(guò)數(shù)據(jù)分析基因的表達(dá)水平在同一個(gè)物種不同組織間的相似性比不同物種的相同組織還要高啸胧。這與之...
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轉(zhuǎn)錄組入門(8)： 差異基因結(jié)果注釋前言 我們統(tǒng)一選擇p<0.05而且abs(logFC)大于1的基因?yàn)轱@著差異表達(dá)基因集虫碉，對(duì)這個(gè)基因集用R包做KEGG/GO超幾何分布檢驗(yàn)分析谨垃。然...
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轉(zhuǎn)錄組入門(7)： 差異基因分析前言 轉(zhuǎn)錄組入門(7)： 差異基因分析這個(gè)步驟推薦在R里面做拯腮，載入表達(dá)矩陣，然后設(shè)置好分組信息潮售，統(tǒng)一用DEseq2進(jìn)行差異分析痊项，當(dāng)然也可以走走e...
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轉(zhuǎn)錄組入門(6)： reads計(jì)數(shù)前言 實(shí)現(xiàn)這個(gè)功能的軟件也很多，還是煩請(qǐng)大家先自己搜索幾個(gè)教程酥诽，入門請(qǐng)統(tǒng)一用htseq-count线婚，對(duì)每個(gè)樣本都會(huì)輸出一個(gè)表達(dá)量文件。需要用腳本...
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轉(zhuǎn)錄組入門(5)： 序列比對(duì)前言 比對(duì)軟件很多盆均，首先大家去收集一下塞弊，因?yàn)槲覀兪菐Т蠹胰腴T，請(qǐng)統(tǒng)一用hisat2泪姨，并且搞懂它的用法游沿。直接去hisat2的主頁(yè)下載index文件...
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轉(zhuǎn)錄組入門(3)：了解fastq測(cè)序數(shù)據(jù)前言 來(lái)源還是生信技能樹。 需要用安裝好的sratoolkit把sra文件轉(zhuǎn)換為fastq格式的測(cè)序文件肮砾，并且用fastqc軟件測(cè)試測(cè)序文件的質(zhì)...
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轉(zhuǎn)錄組入門(2)：讀文章拿到測(cè)序數(shù)據(jù)前言 本課程來(lái)源于生信技能樹诀黍。 本系列課程學(xué)習(xí)的文章是：AKAP95 regulates splicing through scaffoldin...