粗讀了文章中的幾張圖片恕出,整理筆記如下亲茅。 DNA重復(fù) 人類(lèi)基因組包含大量DNA重復(fù)區(qū)域: 這些重復(fù)區(qū)域在染色體上分布情況如下: 重復(fù)區(qū)域的比對(duì) 雖...
rjson讀取json文件的教程自行搜索蝇狼。 以下為使用記錄: 如果僅僅加載rjson焊切,讀取json文件報(bào)錯(cuò): 同時(shí)加載jsonlite順利讀取j...
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16s rRNA結(jié)構(gòu) 大體結(jié)構(gòu)如下: 不同物種高變區(qū)域起始和終止位置稍有不同阶界。 16s rRNA序列提取 根據(jù)gff摘盆,基因類(lèi)型只保留rRNA,剔...
問(wèn)題 artic(conda安裝)對(duì)新冠三代擴(kuò)增子數(shù)據(jù)進(jìn)行分析奏黑,但是運(yùn)行artic minion流程時(shí)炊邦,調(diào)用bcftools出錯(cuò)编矾,內(nèi)容如下: 資...
根據(jù)鏈接[https://zhuanlan.zhihu.com/p/96993644]安裝rticles包,選擇CTeX Documents創(chuàng)建...
通過(guò)計(jì)算edist距離铣耘,如果小于3個(gè)堿基錯(cuò)配洽沟,則認(rèn)為識(shí)別到引物。
宏基因檢測(cè)病原已有多篇專(zhuān)家共識(shí)陸續(xù)發(fā)表蜗细,管理規(guī)定相對(duì)成熟裆操。除了宏基因技術(shù),多重PCR擴(kuò)增結(jié)合高通量測(cè)序因具有高性?xún)r(jià)比炉媒、分析速度快踪区、靈敏度等優(yōu)勢(shì)在...
前言 實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,背景細(xì)菌的存在可能導(dǎo)致交叉污染吊骤,引起假陽(yáng)性的發(fā)生缎岗,從而給mNGS結(jié)果解讀帶來(lái)困擾。mNGS專(zhuān)家共識(shí)中指出白粉,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)該建立背景細(xì)...