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  • @楊博士聊生信 看著南海島嶼的數(shù)量好像有點少罩润,我也不太確定供填。我用Arcmap畫的島嶼看著多一些稻爬。師兄衷掷,你這個GIS文件是不是好多年前的?

    Map--R繪制中國地圖(一)

    今天是國慶節(jié),是祖國母親72華誕,忍不住心潮澎湃啊楚,畫一幅中國地圖,以表拳拳之心浑彰。 今天我們使用R語言來繪制中國地圖恭理。 Step1:準備工作 這里我們需要提前下載幾個R包。 自...

  • R的中國地圖好像版圖有點問題

    Map--R繪制中國地圖(一)

    今天是國慶節(jié),是祖國母親72華誕狈蚤,忍不住心潮澎湃困肩,畫一幅中國地圖,以表拳拳之心脆侮。 今天我們使用R語言來繪制中國地圖。 Step1:準備工作 這里我們需要提前下載幾個R包勇劣。 自...

  • 我也出現(xiàn)了這個問題命咐,請問你解決這個問題了嘛篡九???

    如何使用snpEff創(chuàng)建本地數(shù)據(jù)庫

    snpEff的使用是在Linux系統(tǒng)中Java運行環(huán)境下。 一醋奠、下載snpEff 方法一: 直接在家目錄下載使用命令 wgethttp://sourceforge.net/p...

  • 請問可以一次性畫多個省份嗎榛臼?該怎么寫呀

    R地圖系列(1):maptools包繪制中國地圖

    需要準備的數(shù)據(jù) 繪圖之前需要準備加載的三個包,沒有安裝的同學可以先安裝: library(maps)library(mapdata)library(maptools) 需要準...

  • 您好,請問如果我bismark --bowtie2比對指定產(chǎn)生的sam文件议薪,后來deduplicate_bismark去重復默認產(chǎn)生bam文件尤蛮,使用bismark2summary匯總樣品信息時,無法檢測到bam文件斯议。輸入bismark2summary命令产捞,顯示如下:
    No Bismark/Bowtie2 single-end BAM files detected
    No Bismark/Bowtie2 paired-end BAM files detected
    No Bismark/HISAT2 single-end BAM files detected
    No Bismark/HISAT2 paired-end BAM files detected
    請問這種情況怎么解決呀?謝謝

    bismark 識別甲基化位點-可視化篇

  • 畢業(yè)論文

    數(shù)據(jù)處理 BSA的變異捅位,分析轧葛,找出不利變異,分析變異結構艇搀。 可變剪切的分析尿扯,參考http://www.reibang.com/p/ecef1d9e53e7 Cytoscap...

  • 120
    為什么說FPKM和RPKM都錯了空幻?

    這本是三年多之前我發(fā)在公眾號上的一篇舊文,一些偶然的機會容客,發(fā)現(xiàn)不少朋友也在討論這個問題秕铛,因此我重新做了梳理并發(fā)出來。這樣的討論是有益的缩挑,放在今天也不過時但两,我也愿意和更多的朋友...

  • 請問一下谨湘,我運行gatk HaplotypeCaller的時候,log file里全是
    WARN StrandBiasBySample - Annotation will not be calculated, genotype is not called or alleleLikelihoodMap is null芥丧,這是什么原因呀紧阔?應該怎么處理呀?

    gatk報錯整理

    gatk -V gvcf報錯 報錯內容 報錯原因:gvcf同目錄下缺少idx文件解決方法:復制過來上步驟和gvcf一起生成時候的idx文件過來 gatk安裝調用報錯 在沒激活...

  • 這個系列咋停更了呀?

    BSR-(RNA-seq)數(shù)據(jù)進行BSR分析

    使用工具GATK4娄柳。GATK基礎RNA-seq分析完整版BSR參考GATK官方RNA-seq calling流程最新版的BSR分析流程流程參考WT 3個單株寓辱,混池。三個技術重...

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