發(fā)簡信
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轉(zhuǎn)錄組分析：預處理和質(zhì)控記錄一下分析代碼 1. NGS數(shù)據(jù)準備 2. 參考基因組準備 對于模式植物中贝，可以從多個方面補充一些注釋信息，比如GO和KEGG 到這里镀首，原始數(shù)據(jù)...
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R可視化：KEGG富集分析可視化加載R包 加載數(shù)據(jù)集 KEGG富集分析 結(jié)果轉(zhuǎn)換 選取前20項進行可視化 給各通路加上對應map號 ggplot2柱狀圖可視化 ggplot2氣...
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R語言保存數(shù)據(jù)框為Excel表格
加載R包 寫一個保存為Excel表格的函數(shù) 保存導出
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本地搭建植物KEGG數(shù)據(jù)庫及進行注釋KEGG數(shù)據(jù)庫包含豐富的功能信息及通路注釋，可由此了解生物系統(tǒng)的功能和效用伯复。 而官方已經(jīng)不再免費提供FTP下載氨基酸以及核酸序列庫盈咳，并且KAAS...
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無參物種背景基因GO注釋
相似的基因在不同物種中，其功能往往是保守的边翼。通過GO注釋可獲得跨物種的同源基因及其基因產(chǎn)物的功能描述鱼响。對于非模式生物或者無參考基因組的項目，經(jīng)常...