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  • vim中文輸入亂碼的問題解決

    在用vim寫腳本時,有時注釋的時候想用中文,這樣方便理解閱讀排吴。但在輸入中文時朝抖,會出現(xiàn)亂碼胁附。需要修改一下vim的配置文件转唉。 保存退出网严。

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    K-mer分析

    獨(dú)立實(shí)驗(yàn) 將某隨機(jī)試驗(yàn)重復(fù)N次呼寸,若各次試驗(yàn)結(jié)果互不影響艳汽,即每次試驗(yàn)結(jié)果出現(xiàn)的概率都不依耐于其他各次試驗(yàn)的結(jié)果,則稱這N次試驗(yàn)是獨(dú)立的对雪。 貝努利試...

  • 轉(zhuǎn)錄組分析實(shí)戰(zhàn)第一天就踩的坑——sed與換行符的恩怨

    題目是這樣的: 統(tǒng)計(jì)SRR1039510_1.fastq.gz堿基總數(shù) 1575000 由于上一題已經(jīng)列出了該文件中所有的序列 于是我想河狐,這還...

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    【生信技能樹培訓(xùn)】R語言中文件的讀取

    文件讀取 一、csv格式文件的打開 用Excel打開 用記事本打開瑟捣,打開后顯示逗號分割每一列 sublime打開(適用于大文件) csv的本質(zhì)是...

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    【生信技能樹培訓(xùn)】R語言基礎(chǔ)【20230112更新】

    本培訓(xùn)使用R 4.2及以上版本馋艺。 一、前言 用R分析數(shù)據(jù)得出結(jié)果迈套,需要解決兩個問題: 用什么包/函數(shù)來處理數(shù)據(jù)捐祠?如何整理數(shù)據(jù),使得數(shù)據(jù)可以套進(jìn)函...

  • 給BAM文件建立索引:用于可視化

    當(dāng)進(jìn)行完比對后桑李,有時想要在IGV里面直觀的查看比對的結(jié)果踱蛀,這時候就需要在IGV里面加載BAM文件。同參考序列一樣贵白,BAM文件在IGV里面進(jìn)行加載...

  • 給FASTA文件建立索引2:用于比對

    進(jìn)行序列比對之前率拒,需要首先對參考基因組序列建立索引,這樣使程序在運(yùn)行時能更高效的進(jìn)行比對禁荒。用bwa工具舉例(假設(shè)用于比對的參考基因組序列文件為A...

  • vim中批量刪除包含某一字符串的行

    情況:在下載的樣本信息文本中俏橘,有些值是missing,于是想把這些值都刪去圈浇。 方法:在vim中的命令模式輸入 另存為samples_withou...

  • 根據(jù)項(xiàng)目編號從NCBI上下載樣本信息

    發(fā)表的文章寥掐,如果其數(shù)據(jù)儲存在NCBI上,那么應(yīng)該會在文章中告訴NCBI上的項(xiàng)目編號磷蜀,我們可以據(jù)此下載這篇文章涉及的原始測序數(shù)據(jù)召耘,樣本信息,蛋白序...

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