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dotPlotly－Minimap2比對(duì)paf文件比對(duì)可視化最近進(jìn)行基因組共線(xiàn)性分析小腊，基因組比較大，利用nucmer比對(duì)報(bào)內(nèi)存久窟，改用minimap2進(jìn)行比對(duì)分析秩冈，進(jìn)行可視化發(fā)現(xiàn)dotPlotly[http...
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python-gffutils 修改gff3文件基因名稱(chēng)gff3格式 基因結(jié)構(gòu)注釋文件一般為gff3的格式，一共是9列斥扛，依次為基因組序列id入问，注釋來(lái)源，類(lèi)型犹赖，起始位置队他，終止位置卷仑，得分峻村，正負(fù)鏈，相位锡凝，屬...
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NumPy的使用2019.3.1 星期五 多云 biolearn 創(chuàng)建數(shù)組 數(shù)組屬性 數(shù)組的基本操作 加減乘除四則運(yùn)算 數(shù)組索引 數(shù)組切片...
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MNIST數(shù)據(jù)集介紹及讀取2019.2.23 星期六 多云 biolearn MNIST數(shù)據(jù)集是機(jī)器學(xué)習(xí)領(lǐng)域中非常經(jīng)典的一個(gè)數(shù)據(jù)集粘昨，由60000個(gè)訓(xùn)練樣本和10000...
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線(xiàn)性回歸原理以及Python實(shí)現(xiàn)2018.12.9 星期天 陰 biolearn在統(tǒng)計(jì)學(xué)中，線(xiàn)性回歸是利用線(xiàn)性回歸方程對(duì)一個(gè)或多個(gè)自變量和因變量之間的關(guān)系進(jìn)行建模的一種...
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奇異值分解原理及Python實(shí)例2018.11.28 星期三 晴 biolearn 奇異值分解 SVD（Singular Value Decomposition）是一種重...
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使用cd-hit對(duì)蛋白質(zhì)或核酸序列進(jìn)行聚類(lèi)
2018.9.7 星期四 多云 biolearn cd-hit 是用于蛋白質(zhì)序列或核酸序列聚類(lèi)的工具窜锯，根據(jù)序列的相似度對(duì)序列進(jìn)行聚類(lèi)以去除...
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使用Henikoff框架對(duì)序列進(jìn)行權(quán)重的原理和計(jì)算方法
2018.7.28 星期六 晴 biolearn 通過(guò)blast张肾、hhblits或者其他方式構(gòu)建的多序列比對(duì)（MSA）都存在大量的冗余，這...
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R語(yǔ)言—ggplot2畫(huà)圖如何使用分面原創(chuàng) 2018.6.2 星期六 晴 biolearn 兩種方法：使用 facet_grid() 或 facet_wrap...