發(fā)簡信
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寫了個(gè)小腳本autosnippy:自動(dòng)cgSNP分析
最近寫了一個(gè)snakemake流程，方便自己跑SNP分析舵鳞。目前還是需要手動(dòng)編輯一個(gè)文件表，剩下就是直接等著收樹文件了琢蛤。 安裝 首先克隆git c...
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GBKviz：可能是easyfig最好的替代GBKviz 是一個(gè)基于 web 的 Genbank 數(shù)據(jù)可視化和比較工具蜓堕，使用 streamlit web 框架開發(fā)。 GBKviz 允許用戶...
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【雜談】Word才是最好的PDF閱讀器吧不知道大家知不知道現(xiàn)在Word很早之前開始已經(jīng)可以打開PDF文件了博其，隨意打開一篇文獻(xiàn)： 進(jìn)入了可編輯的狀態(tài)套才，可以直接另存為一份為docx格式，可...
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利用泛基因組挖掘目標(biāo)細(xì)菌的靶標(biāo)基因-Roary,gbksplit和TBtools準(zhǔn)備 1.基因組序列下載與注釋慕淡，使用prokka進(jìn)行注釋背伴，獲得gff文件。參考我前一篇：autoprokka:使用prokka批量注釋 - 簡書...
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Snippy使用時(shí)報(bào)錯(cuò)的解決方法
最近重新安裝Snippy進(jìn)行SNP分析時(shí)，發(fā)現(xiàn)一開始就報(bào)錯(cuò)了傻寂，查看日志中發(fā)現(xiàn)提示沒有安裝bcftools息尺，可是用conda裝的欸怎么可能會(huì)漏軟件...
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用Conda安裝Circos所需的各項(xiàng)依賴版本承接上一篇，最近在導(dǎo)出環(huán)境時(shí)疾掰，順帶把circos的環(huán)境所安裝的所有包導(dǎo)出了搂誉，復(fù)制下面內(nèi)容，保存為circos.yaml文件静檬，運(yùn)行：conda e...
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Circos安裝出問題?這個(gè)安裝組合能一鍵成功安裝CircosCircos安裝感覺一直是個(gè)難題炭懊，各種模塊總會(huì)這里少一個(gè)那里少一個(gè)。最近在學(xué)習(xí)另外一個(gè)軟件時(shí)發(fā)現(xiàn)安裝下面這個(gè)版本去安裝Circos以及幾個(gè)per...
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Resfinder一鍵安裝以及問題解決
準(zhǔn)備工作1.安裝好conda以及mamba2.建立一個(gè)環(huán)境巴柿，命名為resfinderconda create -n resfinder激活環(huán)境s...
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win11下Ubuntu子系統(tǒng)遷移D盤歷程以及遇到的問題由于C盤快爆滿凛虽，將子系統(tǒng)遷移至D盤。直接用系統(tǒng)自帶的命令進(jìn)行遷移广恢。右鍵開始圖標(biāo)凯旋，打開Powershell。 輸入以下命令： 顯示你當(dāng)前安裝的子系...