240 發(fā)簡(jiǎn)信
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    基因組CRISPR序列及Cas酶預(yù)測(cè)

    原文鏈接:基因組CRISPR序列及Cas酶預(yù)測(cè)[https://mp.weixin.qq.com/s/ayOydVsG44Fdl41Uyuja4...

  • Iqtree2:新模型高效構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)

    系統(tǒng)發(fā)育推斷(phylogenetic inference)的算法五花八門(mén)浆劲,從最簡(jiǎn)單的UPGMA法智袭,到鄰接法(neighbor joining)...

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    關(guān)于生物進(jìn)化逻族,研究者們存在哪些分歧?

    關(guān)于生物進(jìn)化目前最大的爭(zhēng)議是什么束昵? 原文鏈接:關(guān)于生物進(jìn)化拔稳,研究者們存在哪些分歧? 距離達(dá)爾文《物種起源》一書(shū)問(wèn)世已經(jīng)160多年了锹雏,然而毫無(wú)疑問(wèn)...

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    基因組相似性計(jì)算:ANI

    在比較基因組分析中巴比,我們經(jīng)常需要分析不同基因組之間的進(jìn)化關(guān)系,例如我們可以使用標(biāo)記蛋白來(lái)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)礁遵。為了進(jìn)行定量的比較轻绞,我們還可以計(jì)算不同基...

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    組間差異分析:Metastats

    文章來(lái)自公眾號(hào):微生態(tài)與微進(jìn)化 Anosim、Adonis佣耐、MRPP等基于群落的組間差異分析可以快速的對(duì)分組的有效性進(jìn)行評(píng)估政勃。然而,有時(shí)候我們還...

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    神秘的細(xì)菌基因組:GC skew

    科學(xué)就是整理事實(shí)兼砖,以便從中得出普遍的規(guī)律和結(jié)論奸远。from 達(dá)爾文 原文鏈接: 每當(dāng)我們拼接出一個(gè)完整的細(xì)菌基因組時(shí),總是迫不及待地畫(huà)出它的圖譜讽挟,...

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    微生物群落展示:要酷酷的云字體懒叛!

    原文:微生物群落展示:要酷酷的云字體! 每當(dāng)你需要展示微生物的群落結(jié)構(gòu) 你是不是已經(jīng)厭倦了 無(wú)休止的條形圖和熱圖 想不想要更大膽前衛(wèi)的展示方式耽梅?...

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    組間差異分析:Anosim

    無(wú)論是野外環(huán)境樣品薛窥,還是室內(nèi)試驗(yàn)樣品,一般我們都會(huì)設(shè)置樣方或平行樣來(lái)增強(qiáng)分析的準(zhǔn)確性眼姐,必要時(shí)還會(huì)進(jìn)行區(qū)組設(shè)計(jì)诅迷,因此在數(shù)據(jù)分析中需要進(jìn)行組間差異的...

  • 好書(shū)推薦——病毒宏基因組學(xué):方法和指南

    目前爆發(fā)的新冠狀病毒再次讓人們意識(shí)到了病毒的重要性。病毒不僅可以使包括人在內(nèi)的動(dòng)植物致病妥凳,也對(duì)生態(tài)與進(jìn)化有著重要的作用竟贯,然而目前人們對(duì)其卻所知甚...

個(gè)人介紹
中山大學(xué)博士,公眾號(hào):微生態(tài)與微進(jìn)化逝钥,歡迎交流生信技術(shù)、R語(yǔ)言與統(tǒng)計(jì)作圖
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