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4. 漂變與物種內(nèi)的遺傳多樣性碎碎念：這一小節(jié)極其硬核，除了一上來(lái)就放一些語(yǔ)焉不詳?shù)墓接?jì)算蛾魄，還有一些關(guān)鍵概念和上一節(jié)解釋不同虑瀑。。滴须。我估計(jì)得多讀幾遍/查查其他資料才能了解在說(shuō)什么舌狗。這段翻譯就先按照原文來(lái)。...
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群體遺傳學(xué)統(tǒng)計(jì)指標(biāo)——種群核苷酸多樣性理論 種群核苷酸多樣性，顧名思義指的就是核苷酸多樣性待德，值越大說(shuō)明核苷酸多樣性越高君丁。通常用于衡量群體內(nèi)的核苷酸多樣性，也可以用來(lái)推演進(jìn)化關(guān)系将宪。計(jì)算公式為： 計(jì)算群體的π值绘闷，可以...
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農(nóng)民的兒子
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總結(jié)各種生物科研工具使用經(jīng)驗(yàn)
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MEGA序列轉(zhuǎn)換位點(diǎn)與顛換位點(diǎn)統(tǒng)計(jì)2020-11-25使用MEGA進(jìn)行序列轉(zhuǎn)換位點(diǎn)與顛換位點(diǎn)統(tǒng)計(jì) 1準(zhǔn)備fas數(shù)據(jù) 換成mega格式 要進(jìn)行序列統(tǒng)計(jì)分析需要meg格式的文件。我用如下方法進(jìn)行轉(zhuǎn)換： 1-先導(dǎo)入fas序列選擇ali...
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收錄比較基因組學(xué)，進(jìn)化基因組學(xué)除呵，群體基因組學(xué)再菊，分子進(jìn)化，及相關(guān)領(lǐng)域的各類文章颜曾。特別地纠拔。由于是簡(jiǎn)書，建樹(shù)的內(nèi)容當(dāng)然是必不可少了泛豪。 歡迎大家投稿
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IQ-TREE的使用 - 超快速用極大似然法構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)
寫在前面 我知道IQ-tree已經(jīng)有很長(zhǎng)一段時(shí)間了诡曙。不過(guò)我一直并沒(méi)有使用它臀叙。主要原因是，常用的快速構(gòu)建ML樹(shù)的軟件是FastTree价卤，如果要求準(zhǔn)確劝萤，我會(huì)在服務(wù)器上使用RaxM...
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用MrBayes構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)操作步驟整理總結(jié)
最近在學(xué)習(xí)構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)，嘗試了用PHYML構(gòu)建ML樹(shù)和用MrBayes構(gòu)建貝葉斯樹(shù)慎璧，因?yàn)闃?gòu)建ML樹(shù)時(shí)用的是網(wǎng)站的PHYML進(jìn)行的床嫌，操作簡(jiǎn)便，所以就未做整理胸私，只詳細(xì)整理了一下貝葉...
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