步驟1：數據質控： fastp代碼如下，保存為fastp.sh 執(zhí)行fastp命令，批量處理fastq文件 步驟2：call SNP榔至，使用GAT...

注意喘先，region.xls和 final_sorted_with_promoter.change.gene文件均為bed格式泊碑。bed格式前3列為...

將當前目錄下大于200Mb缕溉，且沒有壓縮的文件均壓縮 這個命令使用find命令來查找當前目錄下大于200MB且不以".gz"結尾的文件死陆。然后使用-...

如果你想替換特定的樣本名稱待牵，你可以創(chuàng)建一個包含舊名稱和新名稱的文件其屏，然后使用bcftools reheader命令進行替換。這個文件的格式應該是...

安裝 R 包agricolae報錯：installation of package ‘agricolae’ had non-zero exit ...

SnpSift 可以分割染色體缨该，截取部分vcf文件偎行。具體使用方法見：https://blog.csdn.net/weixin_43569478/...

awk '2<42767716 {print 4"\t"$5}' >R04_R4_1.vcf

import osimport xlwings as xw def excel2pdf(file):app = xw.App(visible=T...