240 發(fā)簡信
IP屬地:浙江
  • 2020-02-10

    GSE125042+WGCNA 數(shù)據(jù)下載+預處理 數(shù)據(jù)可用个束,已經(jīng)是log后的數(shù)據(jù)了 WGCNA log2FPKM 提取表達矩陣 篩選sft值 選...

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    2020-02-05

    GSE95070和GSE95426進行聯(lián)合差異基因分析 下載兩個小鼠的數(shù)據(jù)集职车,想對他進行聯(lián)合差異基因分析遮斥。有兩種思路,一是對各個數(shù)據(jù)集進行差異分...

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    數(shù)據(jù)上傳到NCBI

    (不過上傳數(shù)據(jù)真的網(wǎng)要好) http://www.reibang.com/p/ea2cbf68a3ce https://www.jianshu...

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    2019-12-30 WCGNA 2.0

    數(shù)據(jù)準備 按照健明老師的公眾號克婶,進行數(shù)據(jù)準備 step2:確定最佳beta值 選擇合適“軟閥值(soft thresholding power)...

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    2019-12-28學習內(nèi)容

    學習內(nèi)容(WCGNA) 之前在GEO數(shù)據(jù)挖掘的時候出現(xiàn)了問題筒严,所以就去跑了一遍,又熟悉了一下流程情萤,剛好現(xiàn)在來學習一下TCGA 基本概念 WGCN...

  • 2019-12-24TCGA 2.0

    12/2學習內(nèi)容(TCGA 2.0) 上午 繼續(xù)閱讀關(guān)于老師發(fā)的文獻鸭蛙,不過這次老師發(fā)的文獻感覺有點難理解了,需要一定的知識儲備筋岛,所以閱讀的時候不...

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    2019-12-23

    12/2學習內(nèi)容(TCGA) 整理了之前的筆記娶视,然后再操作一下關(guān)于TCGA的數(shù)據(jù)下載,剛好用上次老師完成的對24篇文獻的處理進行處理睁宰,通過看了健...

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    2019-12-21

    12.21Wes -seq筆記總結(jié)1 上午 wes-seq 之前跑了rna-seq的上游總結(jié)了流程肪获,現(xiàn)在想把上周的東西整合歸納一下,在跑一遍 軟...

  • 2019-12-13

    數(shù)據(jù)標準化(中心化+均一化) Center勋陪,就是中心化贪磺。什么是中心化呢?the variables should be shifted to b...

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