現(xiàn)在回想單細胞項目的一些常規(guī)分析薇正，clusters/groups間的差異表達分析（differential expression analysis）幾乎是分析必備項匾鸥，F(xiàn)ind...
IP屬地：遼寧
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seurat-FindAllMarkers()源碼解析 -
We'll do whatever just to stay alive.
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免疫細胞組分 免疫基因 PD1 免疫治療biomarker
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Bismark軟件使用入門
作者：馬可菠蘿 童蒙編輯：angelica 一、甲基化文庫建庫原理 借助重亞硫酸鹽（Bisulfite）轉(zhuǎn)換的方法被認為是金標準挠唆，該化學試劑會將未甲基化的C進行轉(zhuǎn)化，胞嘧啶（...
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周運來，男谒麦，長大了才會遇到的帥哥俄讹，穩(wěn)健，瀟灑绕德，大方患膛，靠譜。一段生信緣耻蛇，一棵技能樹剩瓶。生信技能樹核心成員，單細胞天地供稿人城丧，簡書創(chuàng)作者，單細胞數(shù)據(jù)科學家豌鹤。
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科學院小碩一枚<br>細胞生物學專業(yè)<br>愛好攝影
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2布疙、RNAseq(2)--測序原始數(shù)據(jù)處理（Clean data）1蚊惯、fastq文件 一般我們從公司里得到的原始測序數(shù)據(jù)都是屬于fastq.gz文件, .gz是一種壓縮格式的縮寫愿卸，于是首先第一步是對這些壓縮格式進行解壓操作 解壓好的文件即正...
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NBIS系列單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)（二）：數(shù)據(jù)降維可視化第二節(jié)：數(shù)據(jù)降維可視化 加載所需的R包和質(zhì)控過濾后的數(shù)據(jù) 首先，我們加載分析所需的R包和上一節(jié)中質(zhì)控過濾后的數(shù)據(jù)集截型。 特征選擇篩選高變基因 接下來趴荸，我們需要篩選出數(shù)據(jù)集中細胞...
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scRNAseq靈活的點圖繪制：FlexDotPlot單細胞繪圖系列： Seurat繪圖函數(shù)總結(jié)[http://www.reibang.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2優(yōu)化Seurat繪圖[https...
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R包hdf5r安裝報錯在安裝loomR的時候，必須要先安裝hdf5r 但是hdf5r 這個包一直安裝有問題宦焦，GitHub上有一個issue 專門討論https://github.com/hhoef...
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浙江大學八年制醫(yī)學生
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不看私信<br>看不到的文章是被簡書鎖了
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單細胞測序分析: Seurat 使用教程原文見Seurat - Guided Clustering Tutorial, Compiled: April 17, 2020 #1 Seurat安裝 #2 數(shù)據(jù)下載 Pe...
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計算生物學孵淘、統(tǒng)計學、機器學習<br>
