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西澳大學(xué)生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因組與群體基因組學(xué)的挖掘<br><br>簡信不回答問題倘核，有問題發(fā)至<br>lakeseafly50@gmail.com
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WGD（全基因組復(fù)制）分析——Ka/Ks及4Dtv值計(jì)算一、4Dtv（四倍簡并位點(diǎn)顛換率）的定義 4DTV stands for four-fold synonymous (degenerative) third-codon tr...
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老師，請教一下肝陪，親本的參考基因組，是父本和母本的都需要嗎刑顺？我看您在比對時用的是CE10g_v2.0這套基因組氯窍，但是提取SNP時用的是Mparg_v2.0.fa這套基因組，他們分別是父本和母本的基因組嗎
ASE（等位基因特異性表達(dá)） —— 完整流程
前段時間蹲堂，接了老師一個等位基因特異性表達(dá)的任務(wù)狼讨，前后再加上其他的分析帶著做，再捋流程柒竞，拖拖拉拉也用了小一個月政供，終于從原始測序數(shù)據(jù)，得到了最終的那張table能犯，具體的內(nèi)容基本已...
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睡蓮基因組與開花植物的早期進(jìn)化今天分享一篇文獻(xiàn)沦寂，來自去年12月張亮生團(tuán)隊(duì)發(fā)表在nature上的一篇文章：The water lily genome and the early evolution of f...
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基因家族擴(kuò)張與收縮分析及物種進(jìn)化樹構(gòu)建（下）最近剛返校，事情比較多淘衙，每天也很忙传藏，之前寫的《基因家族擴(kuò)張與收縮分析及物種進(jìn)化樹構(gòu)建（上）》也一直沒來得及更新，缺少cafe輸出結(jié)果的解讀及后面的可視化彤守。最近在簡書上也收到了...
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RNA-Seq：從fastq到表達(dá)矩陣一毯侦、測序數(shù)據(jù)的準(zhǔn)備 新建工作目錄，RNASeq-analysis mkdirRNASeq-analysiscdRNASeq-analysis/ 新建data文件夾具垫； mkdi...
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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三代轉(zhuǎn)錄組系列：使用Cogent重建基因組編碼區(qū)盡管目前已測序的物種已經(jīng)很多了，但是對于一些動輒幾個G的復(fù)雜基因組起宽，還沒有某個課題組有那么大的經(jīng)費(fèi)去測序洲胖，所以仍舊缺少高質(zhì)量的完整基因組，那么這個時候一個高質(zhì)量的轉(zhuǎn)錄組還是能...
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Python Traceback詳解
剛接觸Python的時候燎含，簡單的異常處理已經(jīng)可以幫助我們解決大多數(shù)問題宾濒，但是隨著逐漸地深入腿短，我們會發(fā)現(xiàn)有很多情況下簡單的異常處理已經(jīng)無法解決問題了屏箍，如下代碼，單純的打印異常所...
