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  • 請問大佬憾赁,在相關(guān)性分析的這個(gè)模塊中趟咆,同時(shí)利用腫瘤組織和正常組織述么,比如BRCA Tumor及BRCA Normal的數(shù)據(jù)分析得到的基因間的相關(guān)性結(jié)果怎么解讀呢而昨?期盼回答,不勝感激??

    GEPIA2使用教程

    今天跟大家分享的是一個(gè)在線TCGA基因表達(dá)和生存分析的工具(GEPIA2),2019年發(fā)表在NAR上,目前已更新到2.0版本腿时,訪問網(wǎng)址是http://gepia2.cance...

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    GEPIA2使用教程

    今天跟大家分享的是一個(gè)在線TCGA基因表達(dá)和生存分析的工具(GEPIA2),2019年發(fā)表在NAR上饭宾,目前已更新到2.0版本批糟,訪問網(wǎng)址是http://gepia2.cance...

  • 請問大佬徽鼎,在相關(guān)性分析的這個(gè)模塊中,同時(shí)利用BRCA Tumor及BRCA Normal的數(shù)據(jù)分析得到的ERBB2和EGFR的相關(guān)性結(jié)果怎么解讀呢性湿?期盼回答纬傲,不勝感激??

    GEPIA做相關(guān)性分析

    網(wǎng)址:http://gepia.cancer-pku.cn/[http://gepia.cancer-pku.cn/] 首頁界面如下满败,目前已經(jīng)有更新版GEPIA2(點(diǎn)擊右側(cè)t...

  • GEPIA做相關(guān)性分析

    網(wǎng)址:http://gepia.cancer-pku.cn/[http://gepia.cancer-pku.cn/] 首頁界面如下肤频,目前已經(jīng)有更新版GEPIA2(點(diǎn)擊右側(cè)t...

  • 2021-03-21R語言中的管道符 %>%

    作為R語言基礎(chǔ)之一的 %>% 應(yīng)用非常廣泛,但是我卻一直沒有系統(tǒng)地學(xué)習(xí)暑刃,實(shí)在不應(yīng)該厢漩,今天研究記述一下。 什么是%>% %>% 作為一種管道符岩臣,意思是 %>% 把左邊的輸出傳遞...

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    R語言 Mutate家族

    首先是加載相關(guān)的包溜嗜,mutate主要屬于dplyr包里,這里我們統(tǒng)一使用tidyverse包架谎。tidyverse包中含有各種數(shù)據(jù)整理以及畫圖的包炸宵,如下加載tidyverse包...

  • 小白學(xué)習(xí)R語言會遇到的問題(持續(xù)更新)

    1,為什么讀取數(shù)據(jù)時(shí)要加上options(stringsAsFactors = F) 谷扣,否則總報(bào)錯土全?R語言是不太喜歡因子(factor)這類數(shù)據(jù)的,用的多的多半是向量会涎,矩陣裹匙,...

  • R語言基礎(chǔ)知識筆記

    1、向量是用于存儲數(shù)值型末秃,字符型或者邏輯型數(shù)據(jù)的一維數(shù)組幻件。執(zhí)行組合功能的函數(shù)為c(),可以用來創(chuàng)建向量蛔溃。向量可根據(jù)位置進(jìn)行索引绰沥,需要用[]。 2贺待、矩陣是一個(gè)二維數(shù)組徽曲,每個(gè)元素...

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    TCGA數(shù)據(jù)差異分析后生存分析(批量單因素cox回歸/Lasso篩選,多因素cox建模麸塞,時(shí)間依賴ROC曲線及KM plot可視化)

    測序上游分析系列: mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測序從raw reads到表達(dá)矩陣:上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測序pipeline:從raw r...

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    GSVA自定義基因集分析

    微信公眾號:研平方[#jump_10]關(guān)注可了解更多的科研教程及技巧。如有問題或建議遂铡,請?jiān)诠娞柫粞詺g迎關(guān)注我:一起學(xué)習(xí)肮疗,一起進(jìn)步![#jump_20] 已經(jīng)很久沒有再用R語...

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    文章作圖小技巧

    文章來源:公眾號 科研論文時(shí)間這里分享幾點(diǎn)配圖的作圖小技巧扒接,讓你也能輕松擁有漂亮的配圖伪货! 一、圖片配色 其實(shí)決定圖好不好看的第一要素就是****整體的配色钾怔。 配色的原則是要「...

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    RNA-SEQ(四):火山圖

    題目:DEseq2差異分析得到的差異基因做火山圖碱呼。 目的:火山圖可反映總體基因的表達(dá)情況,通過不同的顏色醒目的展示差異基因的情況宗侦。 內(nèi)容:1. 對DEseq2分析得到的差異基...

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