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@模擬書匠X ????

SAM格式詳細(xì)說明

SAM (Sequence Alignment/Map) 是存儲RNA-seq比對結(jié)果的格式。BWA屹电、Bowtie/Bowtie2器瘪、HISAT/HISAT2、Tophat等均...

模擬數(shù)據(jù)X

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@模擬書匠X 好的爆哑，現(xiàn)在市場上基因測序數(shù)據(jù)量與日俱增洞难，數(shù)據(jù)比對和分析的速度成了一個大問題，對數(shù)據(jù)處理速度這方面需求空間很大揭朝，前景應(yīng)該不錯队贱。

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SAM (Sequence Alignment/Map) 是存儲RNA-seq比對結(jié)果的格式色冀。BWA、Bowtie/Bowtie2柱嫌、HISAT/HISAT2锋恬、Tophat等均...

模擬數(shù)據(jù)X

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”第五列：Mapping quality，比對的質(zhì)量分?jǐn)?shù)抑片，越高說明該read比對到參考基因組上的位置越唯一卵佛；“
這句不對，這個質(zhì)量就是 fastq 文件中的堿基質(zhì)量（fastq 文件的第四行）敞斋，是說明測序儀器測序得到的堿基準(zhǔn)確度截汪，表示的是堿基的錯誤概率的對數(shù)值，和比對到參考基因上位置唯一不唯一無關(guān)植捎，且比對使用的是 Smith-Waterman 算法挫鸽，本身就可能存在兩個或兩個以上的匹配路徑，如：
A-GCG
ACGC-
和
AGCG-
A-CGC

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