小陳生信日記

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mummer進(jìn)行基因組間的比對
下載mummer震嫉，并添加到環(huán)境變量 wget https://gigenet.dl.sourceforge.net/project/mummer...

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bam文件
BAM 文件是一種存儲高通量測序數(shù)據(jù)比對結(jié)果的二進(jìn)制格式价卤。統(tǒng)計 Reads 數(shù)量要獲得 BAM 文件中的 reads（reads 通常指單個...

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基因組簡單組裝
1.PacBio HiFi長讀長測序技術(shù) 長讀長測序能夠檢測長度為1,000到20,000個堿基或更長的DNA（或RNA）片段赤赊。這些片段通常來自...

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教你在linux系統(tǒng)安裝java——2分鐘極速版
下載地址 Java Downloads | Oracle[https://www.oracle.com/java/technologies/do...

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測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評估
1.覆蓋深度 mapping depth 基因組被測序片段（短讀 short reads）“覆蓋”的強(qiáng)度有多大闯狱？每一堿基的覆蓋率是基因組堿基被測...

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shell腳本統(tǒng)計reads數(shù)量和堿基數(shù)量
1.github下載命令 git clone 【網(wǎng)頁】 2.安裝miniconda wget https://mirrors.tuna.tsin...

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imageJ 測量圖片中物體的長度
設(shè)置一個比例尺：像素：長度。就可以測量了抛计。

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克隆數(shù)據(jù)上傳genbank

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測序數(shù)據(jù)上傳SRA數(shù)據(jù)庫
1.先創(chuàng)建一個bioproject submitter 2.選擇數(shù)據(jù)的類型 3.填寫采集樣品的名稱 4.第5哄孤、6、7項直接跳過

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