![240](https://upload.jianshu.io/users/upload_avatars/27328747/4ff61529-093a-4f1d-8839-5881ab2aaa9f.jpg?imageMogr2/auto-orient/strip|imageView2/1/w/240/h/240)
在探究功能基因的時候,我們經(jīng)常需要對所研究的基因/蛋白質(zhì)進行聚類分組驰后,逐個類群探究蛋白功能肆资。創(chuàng)建同源群可以采用Otrhofinder軟件,該軟件...
EffectorP軟件利用機器學習原理灶芝,通過事先收集已知的效應子制備訓練集郑原,從而實現(xiàn)病原真菌和卵菌的效應子預測[1]。 EffectorP發(fā)展史...
全基因組注釋是鑒定生物基因組特征的過程夜涕。Prokka是一個適用于原核生物基因組注釋工具犯犁,可以注釋細菌,古菌和病毒基因組女器。Prokka在預測基因組...
蛋白質(zhì)都是由相似的小型結(jié)構(gòu)域組成的酸役。如果我們有若干個已知的蛋白序列,那我們就可以根據(jù)這些蛋白序列比較其含有的保守域驾胆,尋找在蛋白數(shù)據(jù)庫中上是否也有...
轉(zhuǎn)錄組的組裝能夠提供豐富的組學信息涣澡,是生物信息學中重要的基礎步驟。測序的下機數(shù)據(jù)經(jīng)過過濾丧诺,比對入桂,排序,組裝驳阎,最終得到轉(zhuǎn)錄本的全部序列信息抗愁。下面我...
在組裝未知基因組時,往往需要利用重測序數(shù)據(jù)提前進行基因組調(diào)查呵晚,以獲取其基因組規(guī)模蜘腌,雜合率,重復序列比例劣纲,GC含量等信息逢捺。從而更好地擬定后繼測序策...
人類活動與病原物的擴散息息相關(guān)谁鳍。馴化和育種事件會加速病原物群體擴張癞季。小麥白粉病是由白粉病真菌(Blumeria graminis f. sp. ...
Multiple Sequentially Markovian Coalescent (MSMC)是一種利用馬爾可夫模型推斷群體動態(tài)歷史和群體結(jié)...
馬鈴薯是全球性的重要作物劫瞳,目前商業(yè)種植主要采用的是同源四倍體馬鈴薯塊莖,運輸和種植都多有不便绷柒。因此如果能使用二倍體馬鈴薯種子種植將會降低種植成本...