WGCNA分析基于兩個(gè)假設(shè)：1.相似表達(dá)模式的基因可能存在共調(diào)控、功能相關(guān)或處于同一通路减宣，2.基因網(wǎng)絡(luò)符合無(wú)尺度分布。基于這兩點(diǎn)辛块，可以將基因網(wǎng)絡(luò)根據(jù)表達(dá)相似性劃分為不同的模塊...
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WGCNA實(shí)例分析及解讀（附代碼） -
從原始芯片.cel數(shù)據(jù)到權(quán)重基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)(WGCNA)詳細(xì)流程看這個(gè)之前憨愉，可以先看WGCNA的一些理論背景知識(shí)[http://www.reibang.com/p/e102681ec979]看完整個(gè)之后可以去看WGCNA關(guān)鍵模塊和hub...
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RNA-seq(7): DEseq2篩選差異表達(dá)基因并注釋(bioMart)============================================寫在前面：可以參考另外一篇《得到差異基因后怎么做？[https://www.jians...
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努力學(xué)代碼的超級(jí)無(wú)敵大蝸牛??
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2020-10-29 學(xué)習(xí)小組Day6--文惠
R包安裝躺孝，有多種方法：包括install.package裝載和直接下載R包拖進(jìn)文件夾 dplyr包用法不是很熟悉，重點(diǎn)寫一下：test <- iris[c(1:2,51:52...
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2020-10-28學(xué)習(xí)小組Day5筆記--文惠
R語(yǔ)言基本都會(huì)底桂，我記錄一點(diǎn)不太熟悉的植袍。save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存當(dāng)前所有變量save(X,file="test.RDa...
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2020-10-26學(xué)習(xí)小組Day4筆記--文惠
因?yàn)槲視?huì)用R和R studio，所以筆記比較少 R作圖：plot散點(diǎn)圖boxplot箱線圖清除所有數(shù)據(jù)rm(list=ls())history()查找歷史命令
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歡迎大家來(lái)到我們的生信星球第八十六期訓(xùn)練營(yíng)～“公眾號(hào)：生信星球” 在這里，希望你能收獲知識(shí)和快樂(lè)暮顺，結(jié)識(shí)一幫志同道合的小伙伴 豆豆和花花也會(huì)盡力幫助大家
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2020-10-25 學(xué)習(xí)小組Day3筆記--文惠
miniconda3的安裝厅篓，有兩種方式： 在進(jìn)行前，輸入uname -a查看linux系統(tǒng)版本 復(fù)制miniconda3最新的鏈接捶码，在putty中輸入wget + 地址 下載...
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學(xué)習(xí)小組Day2筆記--文惠1. pwd查看當(dāng)前路徑贷笛，類似于R里的getwd()，個(gè)人覺得也可以用ls（查看當(dāng)前文件夾下文件）來(lái)確認(rèn)路徑宙项，另外ls -l可輸出長(zhǎng)列表格式+詳細(xì)信息 ``` pwd ```...
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周運(yùn)來(lái)，男汇荐，長(zhǎng)大了才會(huì)遇到的帥哥洞就，穩(wěn)健，瀟灑掀淘，大方旬蟋，靠譜。一段生信緣革娄，一棵技能樹倾贰。生信技能樹核心成員，單細(xì)胞天地供稿人拦惋，簡(jiǎn)書創(chuàng)作者匆浙，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家。
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