基因組組裝 1.k-mer 那么我們首先要看一下k-mer是什么。它的定義是:是指將一條序列分成包含k個(gè)堿基的子字符串陡鹃,如果reads長(zhǎng)度為L(zhǎng)间螟,k-mer長(zhǎng)度設(shè)為k汽久,則產(chǎn)生的...
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基因組組裝 1.k-mer 那么我們首先要看一下k-mer是什么。它的定義是:是指將一條序列分成包含k個(gè)堿基的子字符串陡鹃,如果reads長(zhǎng)度為L(zhǎng)间螟,k-mer長(zhǎng)度設(shè)為k汽久,則產(chǎn)生的...
就是你想call變異的區(qū)域
GATK Best Practices — step1 數(shù)據(jù)預(yù)處理(Data Pre-processing)一瞎惫、數(shù)據(jù)預(yù)處理(Data Pre-processing)介紹 這一步主要是對(duì)BWA得到的bam進(jìn)行一系列處理(包括sort/dup的標(biāo)記/堿基質(zhì)量值矯正)券腔,最終得到GATK ...
除非有特殊需求窄刘,比如說(shuō)內(nèi)網(wǎng)服務(wù)器無(wú)法訪問(wèn)外部網(wǎng)站阱驾,或者特別喜歡折騰就谜,否則都沒有必要嘗試下面的操作 構(gòu)建一個(gè)conda本地鏡像,本質(zhì)上就是把a(bǔ)naconda的包都下載了里覆,然后指...