論文 Drivers and trends of global soil microbial carbon over two decades https://www.natu...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：北京
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跟著Nature Communications學(xué)數(shù)據(jù)分析：R語(yǔ)言做隨機(jī)森林模型并對(duì)變量重要性排序 -
R語(yǔ)言編程-Tidyverse 書(shū)籍 - 數(shù)據(jù)清洗1 描述統(tǒng)計(jì) 不同概率分布就是不同隨機(jī)現(xiàn)象規(guī)律性的數(shù)學(xué)描述。統(tǒng)計(jì)學(xué)最常用的四大概率分布：正太分布惑芭，t分布， 卡方分布，F(xiàn)分布匆绣。數(shù)據(jù)分布形狀的統(tǒng)計(jì)量： 偏度（skewness,...
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【R畫(huà)圖學(xué)習(xí)22.1】進(jìn)化樹(shù)和氣泡組合圖今天學(xué)習(xí)繪制下面這個(gè)paper里面的一個(gè)圖扮念。 從圖中，可以看出闪唆，圖片分成2個(gè)部分盅粪，左邊是進(jìn)化樹(shù)，右邊是類(lèi)似氣泡圖悄蕾。 下面我們用一組簡(jiǎn)單的文件進(jìn)行測(cè)試： 進(jìn)化樹(shù)文件： (((A...
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機(jī)器學(xué)習(xí)識(shí)別與潛在發(fā)病機(jī)制相關(guān)的骨質(zhì)疏松癥代謝相關(guān)因素Typing characteristics of metabolism-related genes in osteoporosis 骨質(zhì)疏松癥中的代謝相關(guān)基因的類(lèi)型特征 發(fā)...
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【R畫(huà)圖學(xué)習(xí)15】啞鈴圖啞鈴圖票顾，又叫做棒棒糖圖。因其形狀和棒棒糖相似而得名帆调，具體來(lái)看實(shí)際上是一個(gè)散點(diǎn)和一條線段的組合奠骄。棒棒糖圖是散點(diǎn)圖的一種變體，又與柱狀圖非常相似番刊，但其在清晰展示數(shù)據(jù)的同時(shí)含鳞，減少了...
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跟著春晚學(xué)配色：R語(yǔ)言ggplot2作圖好看的春晚配色大年三十晚上全程看完了春晚，雖然節(jié)目很爛芹务，還是全程堅(jiān)持看完了蝉绷，《國(guó)色》那個(gè)節(jié)目還是很驚艷的，如果去掉唱歌的環(huán)節(jié)枣抱，可以給打十分熔吗。今天的推文我們把其中的配色摘下來(lái)，可以試著用在我...
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常用的基因組數(shù)據(jù)庫(kù)匯總原文地址：http://www.360doc.com/content/18/0127/20/19913717_725596003.shtml[http://www.360do...
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小鬼的WGCNA分析詳解(二)-菌根共生機(jī)制分析范圍實(shí)例詳解二：真菌與宿主互作的分子機(jī)制--菌根共生 此次講解的文章信息如下： Title：Dual RNA-seq reveals large-scale non-co...
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菌根教材閱讀DrAft - 菌根侵染
不是很好讀的書(shū)沃但。因?yàn)檫@個(gè)話題涉及的內(nèi)容已經(jīng)不是基礎(chǔ)生物學(xué)的內(nèi)容了磁滚，很多真菌生物學(xué)的知識(shí)我沒(méi)學(xué)過(guò)_(:з」∠)_ 但是既然以后要研究這個(gè)方向的話，還是硬著頭皮也讀_(:з」∠)...
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文獻(xiàn)閱讀1：菌根網(wǎng)絡(luò)相關(guān)開(kāi)個(gè)很隨意的記錄貼來(lái)監(jiān)督自己讀讀書(shū)（因?yàn)橐獙?xiě)論文了宵晚，得關(guān)注一下論文垂攘，教材先暫停_(:з」∠)_ 2020年4月27日22:56:32 這篇文章去年讀了一小段。這幾天為了寫(xiě)論文...
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超實(shí)用的菌根網(wǎng)站和《菌根手冊(cè)》前人種樹(shù)淤刃，后人乘涼晒他。幾年前，我剛涉足菌根領(lǐng)域時(shí)對(duì)菌根還是一無(wú)所知逸贾，后來(lái)無(wú)意間找到這個(gè)菌根網(wǎng)站陨仅，如獲至寶津滞，尤其是里面內(nèi)容豐富的菌根手冊(cè)，時(shí)至今日對(duì)我依然實(shí)用灼伤。當(dāng)然触徐，這多虧國(guó)內(nèi)外...
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QIIME2微生物組分析流程
QIIME2功能介紹 1、數(shù)據(jù)導(dǎo)入 示例 2狐赡、生成OUT表 示例 3撞鹉、操作特征表 特征表統(tǒng)計(jì) 過(guò)濾特征表：過(guò)濾樣本 4、多樣性分析 核心多樣性（無(wú)系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)） alpha多樣...
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[復(fù)現(xiàn)NC]R語(yǔ)言一鍵畫(huà)表達(dá)量箱線圖并添加顯著性|轉(zhuǎn)載可視化結(jié)果： 數(shù)據(jù)輸入 畫(huà)圖數(shù)據(jù)需要兩個(gè)文件颖侄，一個(gè)是表達(dá)量數(shù)據(jù)鸟雏，列為樣本，行為基因览祖。另外一個(gè)是注釋信息孝鹊，是關(guān)于樣本分組的。 表達(dá)數(shù)據(jù)： 樣本信息： 代碼
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跟著Nature學(xué)作圖:R語(yǔ)言ggplot2環(huán)形堆積柱形圖完整示例論文 A global reptile assessment highlights shared conservation needs of tetrapods https:...
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跟著B(niǎo)ioRxiv學(xué)作圖：R語(yǔ)言ggalluvial包繪制烧沟伲基圖論文 Environmentally robust cis-regulatory changes underlie rapid climatic adaptation htt...
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R語(yǔ)言_文件讀取與保存把外部數(shù)據(jù)讀入R語(yǔ)言里以及在R語(yǔ)言處理的數(shù)據(jù)導(dǎo)出又活，怎么操作以及注意哪些細(xì)節(jié)： 1.認(rèn)識(shí)csv格式2.認(rèn)識(shí)分隔符3.將表格文件讀入R語(yǔ)言，成為數(shù)據(jù)框4.將數(shù)據(jù)框?qū)С雒痰浚蔀楸砀裎?..
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基于R語(yǔ)言的微生物群落組成多樣性分析——共線性網(wǎng)絡(luò)分析????之前有一位粉絲后臺(tái)留言說(shuō)能不能出一期有關(guān)于共線性網(wǎng)絡(luò)的文章皇钞，說(shuō)實(shí)話，小編之前只在文獻(xiàn)中看到過(guò)這類(lèi)圖松捉，對(duì)于其原理也是迷迷糊糊」堇铮看了好多別人寫(xiě)的文章隘世，根據(jù)大佬們的思路，我...
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【R 基礎(chǔ)】補(bǔ)充篇 轉(zhuǎn)錄組分析儲(chǔ)備1 介紹R及R Studio 右上角history鸠踪，To Console選擇到左下角丙者，To Source選擇到左上編輯器內(nèi)。 畫(huà)圖沒(méi)出圖：dev.off 包的安裝路徑：.li...
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跟著Nature Medicine學(xué)作圖--復(fù)雜熱圖從這個(gè)系列開(kāi)始营密，師兄就帶著大家從各大頂級(jí)期刊中的Figuer入手械媒，從仿照別人的作圖風(fēng)格到最后實(shí)現(xiàn)自己游刃有余的套用在自己的分析數(shù)據(jù)上！這一系列絕對(duì)是高質(zhì)量评汰！還不趕緊點(diǎn)贊+在看...