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eggnog 下載 下載數(shù)據(jù)庫(kù) 測(cè)試使用 結(jié)果 使用 EggNOG功能注釋數(shù)據(jù)庫(kù)在線和本地使用應(yīng)該是最好的eggnog-mapper功能注釋教程

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CD-HIT cd-hit 是用于蛋白質(zhì)序列或核酸序列聚類的工具，根據(jù)序列的相似度對(duì)序列進(jìn)行聚類以去除冗余的序列，一般用于構(gòu)建非冗余的數(shù)據(jù)集用于后續(xù)的實(shí)驗(yàn)分析吗蚌。 通常來說瓣距，根...

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ProkkaProkka: rapid prokaryotic genome annotation竣灌，快速的原核基因組注釋 下載 注釋contig Prokka 結(jié)果說明 Ex...

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BWAbwa 是一款將序列比對(duì)到參考基因組上的軟件档玻，包含了以下3種算法BWA-backtrackBWA-SWBWA-MEMBWA-backtrack適合比對(duì)長(zhǎng)度不超過100b...

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bowtie2測(cè)序數(shù)據(jù)分析軟件谱姓，Bowtie是一個(gè)超快的衩侥，存儲(chǔ)高效的短序列片段比對(duì)程序国旷。它能夠以每小時(shí)處理2500萬35bp reads的速度，將短的DNA序列片段（read...

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Megahit組裝 Megahit QUAST評(píng)估 下載 試用 質(zhì)量評(píng)估 QUAST評(píng)估結(jié)果包含contig總數(shù)量、每個(gè)長(zhǎng)度段的contig數(shù)量峦萎、最大contig長(zhǎng)度屡久、con...

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binning分箱Metabat2Metabat2分箱的步驟： 建索引；2. 比對(duì)爱榔；3. sam2bam被环；4. bam2sorted.bam；5. 計(jì)算contig深度详幽；6....