今天繼續(xù)給大家分享2020年11月4日在3區(qū)《DNA and Cell Biology》(IF=3.191)刊登的一篇生信分析在肝癌研究應(yīng)用的文章,文章標(biāo)題:Bioinfor...
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今天繼續(xù)給大家分享2020年11月4日在3區(qū)《DNA and Cell Biology》(IF=3.191)刊登的一篇生信分析在肝癌研究應(yīng)用的文章,文章標(biāo)題:Bioinfor...
GEO數(shù)據(jù)挖掘系列文-第一期-膠質(zhì)母細(xì)胞瘤http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzUzMTEwODk0Ng==&mid=2247486156&id...
前言 NCBI Gene Expression Omnibus(基因表達(dá)綜合數(shù)據(jù)庫(kù),GEO)公開了很多高通量基因組學(xué)數(shù)據(jù)集。盡管名字很好聽莉掂,但這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)并不是專門針對(duì)基因表達(dá)...
生信學(xué)習(xí)資料 自學(xué)生信不求人,現(xiàn)在網(wǎng)上資料越來越豐富高帖,但是資料多也意味著魚龍混雜找御,并且讓人無從選擇。正確做法應(yīng)該是乳丰,找一個(gè)適合自己且完善靠譜的學(xué)習(xí)資料掌测,從頭到尾跟一遍,代碼敲...
健明大神說過若是想學(xué)會(huì)使用R包产园,就去看那個(gè)包的說明書汞斧,因此去學(xué)習(xí)了GEOquery包說明書。翻譯不當(dāng)之處請(qǐng)去看原文什燕。文章來源:http://www.bioconductor....
今天開始會(huì)寫一系列關(guān)于用R進(jìn)行基因芯片分析的文章粘勒,算是對(duì)該流程的總結(jié)。之前學(xué)習(xí)了通過circos來畫圈圖屎即,以及通過MCScanX進(jìn)行基因家族的共線性分析庙睡,放一張結(jié)果先: 逼格...
你不得不知道的GEO數(shù)據(jù)庫(kù)芯片數(shù)據(jù)分析方法 大家好乘陪,我是阿琛。今天來給大家介紹一個(gè)新的專題內(nèi)容---GEO數(shù)據(jù)庫(kù)的使用方法雕擂。烹飪需要食材啡邑,分析需要數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)出發(fā)井赌,整個(gè)研究的第...
以下是B站生信技能樹GEO數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘的課程筆記 主要內(nèi)容及學(xué)習(xí)目的: 介紹GEO數(shù)據(jù)庫(kù):了解數(shù)據(jù)存放位置谤逼; 介紹GSE項(xiàng)目的3種下載方式; 介紹ID轉(zhuǎn)換:使用R語(yǔ)言技巧實(shí)現(xiàn)基...
學(xué)習(xí)R語(yǔ)言的第一步除了下載軟件外仇穗,應(yīng)該就是讀取和寫出數(shù)據(jù)了森缠,有了數(shù)據(jù)我們才能進(jìn)行其他操作,今天為大家介紹R語(yǔ)言讀取仪缸、寫出數(shù)據(jù)的操作贵涵。 1、不需要代碼的讀取數(shù)據(jù)的操作 (1)F...