全基因組關(guān)聯(lián)分析（Genome-wide association study，GWAS）是應用基因組中數(shù)以百萬級別的單核苷酸多樣性（Single Nucleotide Plo...
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全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)protocol -
SNP calling 幾張圖Graphical representation of allelic heterogeneity at a locus with common and low freque...
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學生信的那些事兒之十六 - 生信技能樹VCF格式文件的shell小練習
開始做題前需要生成vcf文件先： 想要順利的把題目做完，基礎的Linux命令當然需要熟練運用芽唇，更關(guān)鍵的是對 vcf 文件格式和內(nèi)容的了解载慈。 把突變記錄的vcf文件區(qū)分成 IN...
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「三代組裝」Pacbio組裝后如何用自身數(shù)據(jù)進行polish
三代數(shù)據(jù)由于其高錯誤率(目前應該是10%左右), 即便在組裝前有一步糾錯環(huán)節(jié)丰包，但是組裝得到序列依舊存在著許多錯誤饶唤，因此需要進行polish環(huán)節(jié)肄程。polish分為兩個層次，三代...
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功能注釋后如何做富集分析功能注釋后如何做富集分析 本文是為了回答知識星球里的一個提問得湘，他為了用clusterProfiler做富集分析杖玲，打算構(gòu)建一個OrgDb，也就是物種數(shù)據(jù)庫忽刽。 我之前寫過用Bio...
