寫在前面的話：GSEA對于生物信息學(xué)技能的要求不高撰豺，以至于不需要太多的生信知識就能學(xué)會，這也成為了生物研究生的必備技能珊燎，如果你還不會的話众眨，這篇教程將讓你100%學(xué)會智厌，只要你從...
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limma 差異分析透徹講解基因表達(dá)差異分析是我們做轉(zhuǎn)錄組最關(guān)鍵根本的一步香追，edgeR+limma是目前最為推薦的方式搜吧。本文結(jié)合示例數(shù)據(jù)，將對這個過程進(jìn)行梳理杨凑，讓你明白limma包的why滤奈，what，h...
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使用limma撩满、Glimma和edgeR對RNA-seq數(shù)據(jù)分析筆記1 摘要 簡單且高效地分析RNA測序數(shù)據(jù)的能力正是Bioconductor的核心優(yōu)勢之一蜒程。在獲得RNA-seq基因表達(dá)矩陣后，通常需要對數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理伺帘、探索性數(shù)據(jù)分析昭躺、差異表...
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14種單細(xì)胞測序去批次效應(yīng)哪家強(qiáng)
今天跟大家分享的是2020年1月發(fā)表在Genome Biol.（IF：14.028）雜志上的一篇文章A benchmark of batch-effect correctio...
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差異表達(dá)基因分析：差異倍數(shù)(fold change), 差異的顯著性(P-value)Differential gene expression analysis：差異表達(dá)基因分析 Differentially expressed gene (DEG)：差異表達(dá)...
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RNA-seq中的那些統(tǒng)計(jì)學(xué)問題（二）FPKM/RPKM之外的那些標(biāo)準(zhǔn)化方法目錄 1. 標(biāo)準(zhǔn)化1.1. House-keeping gene(s)1.2. spike-in1.3. CPM1.4. TCS1.5. Quantile1.6. Media...
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三分讀書丨如何成為一個更厲害的人王瀟瀟灑姐常常掛在嘴邊的一句話是，“勇猛精進(jìn)”伪嫁。很喜歡這句slogan领炫，“精進(jìn)”意味著熟練和進(jìn)步，“勇猛”意味著高效和果斷张咳。進(jìn)步當(dāng)然是好事帝洪，但遲緩的進(jìn)步就像過期的禮物，很難讓...
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你的蒼山脚猾，我的洱海蒼山不墨千秋畫葱峡，洱海無弦萬古琴。未到大理龙助，心思卻已被這句話撩撥砰奕。 我是一個非常喜歡海的姑娘，我出生在一個海洋資源豐富的城市，又在另一個名字帶“壕”的城市長大仅淑。于我而言，不管是...
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跑步有什么意思案悄纭漓糙？今天和一群小伙伴跑了個馬拉松，準(zhǔn)確來說烘嘱，我和一小撮兒群眾參加了五公里的快樂跑昆禽，大部分人參加的是半馬，有幾位大牛參加了全馬（而且竟然完成了蝇庭，真的是大牛醉鳖，至少不再是人類了）。 不...
