近年來癌别，隨著空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的發(fā)展與普及，相關(guān)的數(shù)據(jù)的積累也越來越多，面對(duì)如此大量的數(shù)據(jù)，如何高效地利用這些已發(fā)表的數(shù)據(jù)為后續(xù)的研究提供思路與參考，這里我們將分享幾個(gè)實(shí)用的空轉(zhuǎn)...
發(fā)簡(jiǎn)信
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空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫集合 -
R與機(jī)器學(xué)習(xí)系列|15.可解釋的機(jī)器學(xué)習(xí)算法（Interpretable Machine Learning）（下）今天我們介紹可解釋機(jī)器學(xué)習(xí)算法的最后一部分，基于XGBoost算法的SHAP值可視化。關(guān)于SHAP值其實(shí)我們之前的很多個(gè)推文中都介紹到腹殿，不論是R版本的還是Python版本的，...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序---多樣本整合分析完整代碼
最近做了天然胸腺單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果的分析例书，我在GEO數(shù)據(jù)庫中下載了10個(gè)樣本（GSE182135）锣尉，完整的的代碼如下，做一個(gè)記錄决采，還在摸索階段自沧，如果有不對(duì)的地方也請(qǐng)大佬們指正。后...
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最全面的GEO單細(xì)胞數(shù)據(jù)挖掘
單樣本官方分析流程：http://www.reibang.com/p/2314a472317f[http://www.reibang.com/p/2314a472317f...
