SIFT4G[https://sift.bii.a-star.edu.sg/sift4g/Commandline.html] 使用方法:1.下載對(duì)應(yīng)物種的SIFT數(shù)據(jù)庫(kù)htt...
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基因流(也稱(chēng)基因遷移)是指從一個(gè)物種的一個(gè)種群向另一個(gè)種群引入新的遺傳物質(zhì),從而改變?nèi)后w“基因庫(kù)”的組成。通過(guò)基因交流向群體中引入新的等位基因,是遺傳變異一個(gè)非常重要的來(lái)源,...
一透敌、KEGG分析 通過(guò)這篇文章上的網(wǎng)站進(jìn)行小麥的KEGG分析 1)點(diǎn)擊analyze data 2)粘貼自己的基因名稱(chēng)數(shù)據(jù) 3)提交數(shù)據(jù)并進(jìn)行分析 4)查看mapping到的...
群體進(jìn)化與選擇信號(hào):●生活在世界不同區(qū)域的生物群體在歷史長(zhǎng)河中經(jīng)歷千萬(wàn)年的自然選擇、人工馴化、遷徙鳍悠、遺傳漂變等事件的洗禮,有的物種滅絕坐搔,有的物種分化出不同的亞種或亞群,甚至逐...
圖形泛基因組(圖泛)以節(jié)點(diǎn)和路徑的形式存儲(chǔ)和展示物種的變異信息藏研,關(guān)鍵作用是擴(kuò)展線(xiàn)性參考基因組的坐標(biāo)系統(tǒng),以容納更多的遺傳多樣性區(qū)域概行。本文首先總結(jié)了圖泛構(gòu)建方法蠢挡,然后討論了圖泛...
我不是老師,也不是大神业踏,更不是前輩禽炬。我只是個(gè)普通的科研工作者,一個(gè)只想努力變得更好的人勤家。 來(lái)到簡(jiǎn)書(shū)快3年了腹尖,期間寫(xiě)了不少的筆記。很多的筆記是在疫情嚴(yán)重時(shí)wfh的時(shí)候?qū)懙姆ゲ薄V两?..
以下代碼均來(lái)自GO-plot的manual(GOplot (wencke.github.io)[https://wencke.github.io/])热幔。GO-plot用條形圖...
●選擇信號(hào):生物在自然選擇或人工選擇過(guò)程中,由于選擇作用在基因組上留下的遺傳多態(tài)性降低讼庇、連鎖不平衡等選擇印記绎巨。●選擇性清除(selective sweep):受選擇基因座位的...