連續(xù)純合片段（runs of homozygosity, ROH）是親代將同源相同的單倍型傳遞給子代而形成的鄙才，基于ROH計算的基因組近交系數(shù)是個體真實(shí)的近交系數(shù)庵朝，它比傳統(tǒng)系譜...
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ROH、近交系數(shù)脏答、親緣系數(shù)续誉、IBD童太、IBS -
重磅干貨：外顯子的那些疑問
作者：Raymon T編輯：angelica 外顯子組分析有助檢測出和疾病相關(guān)的編碼區(qū)突變阱洪，從而研究DNA變異對正常生物學(xué)機(jī)制與疾病發(fā)病機(jī)制的影響芬迄。繼上篇關(guān)于外顯子在實(shí)驗(yàn)方面...
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R-可視化之顏色與色板選擇在用R繪圖時问顷，顏色設(shè)置是美化過程中不可缺少的一步，這次簡單的學(xué)習(xí)與總結(jié)一下禀梳。 一杜窄、在R中顏色的表示 （1） 顏色的名字 built-in color names R內(nèi)置了65...
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ROH分析及熱點(diǎn)區(qū)域計算0寫在前面 腳本方面充斥著CHATGPT，復(fù)制粘貼算途。盡管每個步驟都實(shí)際運(yùn)行過羞芍，但因?yàn)槭且贿厡?shí)驗(yàn)一邊寫，難免存在錯誤各種排版郊艘，細(xì)節(jié)問題懶得細(xì)摳了這篇文章又被鎖定了 1.文件處理...
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利用基因組信息改善牲畜 -綜述（2019）閱讀Michel Georges綜述的筆記荷科。這邊綜述從家畜物種（即牛、綿羊纱注、山羊畏浆、豬、家禽和鮭魚）的可用基因組資源的狀況狞贱，以及如何使用這些資源來加速缺陷致病基因的發(fā)現(xiàn)和管理刻获，...
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2-群體遺傳的基礎(chǔ)介紹1 易混淆的概念 等位基因（alleles）基因型（genotypes）單倍型（Haplotype）二倍型（Diplotype） 基因座位 VS. 等位基因 兩者的區(qū)別關(guān)鍵：...
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RNA-seq： 用perl進(jìn)行基因ID轉(zhuǎn)換RNAseq上游分析得到的矩陣通常是如下的基因id，這對于我們找差異基因不夠直觀瞎嬉，所以做差異分析之前一般會進(jìn)行一個基因id轉(zhuǎn)換蝎毡。 輸入文件 即轉(zhuǎn)換為這種格式，方法如下氧枣。 輸出...
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GeneiASE —— ASE檢驗(yàn)
在ASEReadCounter完成位點(diǎn)的覆蓋度信息計數(shù)統(tǒng)計之后沐兵，還需要對位點(diǎn)添加基因ID，隨后做二項(xiàng)分布和費(fèi)舍爾精確檢驗(yàn)便监，這里推薦GENEiase軟件扎谎。 ASE （等位基因特...
