MC學(xué)公衛(wèi) - 簡(jiǎn)書(shū)

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1. Basics 加載dataset - use ''path\to\file'' 清除dataset - clear 簡(jiǎn)單運(yùn)算 - dis...

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ggplot2：堆積柱狀圖與餅圖間不得不說(shuō)的故事
學(xué)會(huì)用ggplot2畫(huà)堆積圖就等于學(xué)會(huì)畫(huà)餅圖簸喂，這樣一石二鳥(niǎo)的干貨，還不繼續(xù)往下看嗎燎潮？堆積柱狀圖（或百分比堆積圖）與餅圖都是我們常用的直觀描述數(shù)...

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實(shí)驗(yàn)記錄13: scanpy細(xì)胞分化軌跡推斷大型真香現(xiàn)場(chǎng)
與上次翻車(chē)實(shí)驗(yàn)的不同：過(guò)濾了更多的細(xì)胞和基因喻鳄。在處理數(shù)據(jù)時(shí)，低質(zhì)量的細(xì)胞一定要清除掉确封，告誡大家寧缺毋濫除呵。。隅肥。否則后續(xù)分析真的是一堆的噪點(diǎn)竿奏。跳...

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ggplot2：如何優(yōu)雅地繪制箱線圖
數(shù)據(jù)可視化是將數(shù)據(jù)直觀展示出來(lái)的一個(gè)必不可少的步驟。ggplot2是一個(gè)非常常見(jiàn)的繪圖R包腥放，在文獻(xiàn)中泛啸，我們常常會(huì)看見(jiàn)用漂亮箱線圖來(lái)展示原始數(shù)據(jù)的...

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實(shí)驗(yàn)記錄12: scanpy軌跡分析的大型翻車(chē)現(xiàn)場(chǎng)
3月29日天氣晴心情雷暴 Preprosessing the data Denoising the graph（will skip it n...

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Linux 批量修改文件名
用rename命令rename 原名替換名要改的文件例子：將CB都改為BM：

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實(shí)驗(yàn)記錄11：scanpy對(duì)scRNA-seq數(shù)據(jù)的聚類(lèi)分析
R在讀取和處理數(shù)據(jù)的過(guò)程中會(huì)將所有的變量和占用都儲(chǔ)存在RAM當(dāng)中，這樣一來(lái)秃症，對(duì)于海量的單細(xì)胞RNA-seq數(shù)據(jù)（尤其是超過(guò)250k的細(xì)胞量）候址，即...

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Linux 查看磁盤(pán)空間df和du
1. df 查看磁盤(pán)空間大小這個(gè)命令是查看磁盤(pán)各個(gè)分區(qū)的空間大小、占用种柑、可用等信息岗仑。在任意一個(gè)目錄下輸入df：Filesystem：文件系統(tǒng)U...

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Single-cell RNA-seq reveals new types of human blood dendritic cells, monocytes, and progenitors
scRNA-seq鑒定出新的人類(lèi)血液的細(xì)胞類(lèi)型：DC，單核細(xì)胞聚请，祖細(xì)胞http://science.sciencemag.org/content...

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