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提取序列 blast -evalue 參數(shù)設(shè)置了期望閾值( E-value )為 1e-5, E-value 是衡量比對結(jié)果顯著性的一個重要指標(biāo)...
查看vcf基因型 過濾基因型
根據(jù)基因列表,統(tǒng)計SV注釋文件中瓜贾,基因受到SV影響的數(shù)目 合并表格 R統(tǒng)計結(jié)果
第一步 使用pbsv比對 第二步 第三步 群call
R代碼畫直的染色體分布圖 差異表達(dá)基因(RNA-seq)、開放染色質(zhì)(DNase/ATAC-seq)龟劲、CTCF結(jié)合位點(ChIP-seq)胃夏、突變...
采用的策略: 起始位置減去終止位置為標(biāo)記長度昌跌,如果距離大于100kb仰禀,保留這一行,如果標(biāo)記是1或2蚕愤,下一個標(biāo)記(0答恶,來自親本1)的長度小于100...